More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0335 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0335  PKD domain containing protein  100 
 
 
984 aa  2031    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  48.79 
 
 
1151 aa  837    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5054  PKD domain containing protein  40.47 
 
 
1135 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  48.11 
 
 
941 aa  842    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  67.09 
 
 
918 aa  1324    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3440  PKD domain containing protein  44.01 
 
 
1143 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1903  Carbohydrate binding family 6  39.56 
 
 
918 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.602156  normal  0.263579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  45.31 
 
 
1142 aa  833    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  38.62 
 
 
909 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  40.65 
 
 
1138 aa  608  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  38.8 
 
 
1182 aa  576  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  39.56 
 
 
908 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.89 
 
 
1200 aa  399  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  38.1 
 
 
1505 aa  381  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  39.25 
 
 
1444 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.5 
 
 
945 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.25 
 
 
953 aa  331  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
800 aa  330  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  33.73 
 
 
1194 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  26.51 
 
 
1029 aa  130  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  24.37 
 
 
1081 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.27 
 
 
396 aa  104  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  28.74 
 
 
394 aa  102  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.62 
 
 
369 aa  102  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  24.14 
 
 
892 aa  99.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  23.57 
 
 
999 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  23.57 
 
 
999 aa  99  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  23.79 
 
 
1132 aa  98.2  7e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.96 
 
 
413 aa  97.8  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0760  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 
387 aa  96.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0733756  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  23.41 
 
 
999 aa  97.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1160  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
377 aa  96.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3156  glucose sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
376 aa  95.9  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  27.21 
 
 
2172 aa  96.3  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  26.86 
 
 
371 aa  95.5  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  25.21 
 
 
841 aa  95.1  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3844  glucose sorbosone dehydrogenase  29.5 
 
 
407 aa  94.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  26.07 
 
 
411 aa  93.6  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  26.48 
 
 
419 aa  93.2  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.86 
 
 
450 aa  91.7  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.36 
 
 
392 aa  91.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 
428 aa  90.1  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  26.58 
 
 
386 aa  89  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.88 
 
 
428 aa  89  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  22.97 
 
 
1657 aa  88.6  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3260  cytochrome C transmembrane protein  53.42 
 
 
141 aa  88.2  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.812906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  54.55 
 
 
110 aa  88.2  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1006  cytochrome c, class I  54.79 
 
 
112 aa  87.4  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  23.02 
 
 
972 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.76 
 
 
442 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4259  soluble aldose sugar dehydrogenase YliI (Asd)  26.35 
 
 
383 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  53.25 
 
 
110 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 
382 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  25 
 
 
422 aa  86.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4812  glucose sorbosone dehydrogenase  25.34 
 
 
387 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 
399 aa  85.5  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2193  glucose sorbosone dehydrogenase  27.61 
 
 
375 aa  85.9  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3771  hypothetical protein  27.25 
 
 
387 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.185303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  23.87 
 
 
461 aa  84.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2262  glucose dehydrogenase  27.74 
 
 
384 aa  84.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3256  cytochrome c, class I  44.44 
 
 
108 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1678  glucose sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 
388 aa  83.2  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.28 
 
 
367 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.37 
 
 
809 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3130  cytochrome c class I  46.05 
 
 
115 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2315  glucose/sorbosone dehydrogenase  26.76 
 
 
412 aa  83.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  27.64 
 
 
366 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1945  glucose sorbosone dehydrogenase  27.47 
 
 
388 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.404392  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.66 
 
 
729 aa  83.6  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3458  cytochrome c class I  46.05 
 
 
115 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.15 
 
 
585 aa  82.8  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2401  glucose sorbosone dehydrogenase  24.43 
 
 
374 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 
432 aa  82.4  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.87 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50010  putative dehydrogenase  27.49 
 
 
382 aa  82.4  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0339518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3424  cytochrome c, class I  50 
 
 
108 aa  81.6  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  26.84 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  23.32 
 
 
395 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  44.44 
 
 
102 aa  80.9  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  24.21 
 
 
712 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2615  hypothetical protein  26.14 
 
 
381 aa  80.9  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0408  cytochrome c class I  46.07 
 
 
116 aa  80.9  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  26.81 
 
 
405 aa  80.5  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.95 
 
 
414 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3189  glucose sorbosone dehydrogenase  25.08 
 
 
381 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0411882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  49.37 
 
 
106 aa  80.1  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4310  putative cytochrome c, class I  46.07 
 
 
118 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  22.9 
 
 
395 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4807  glucose sorbosone dehydrogenase  25.63 
 
 
392 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916412  normal  0.104055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.31 
 
 
455 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16890  hypothetical protein  25.99 
 
 
378 aa  80.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3307  glucose sorbosone dehydrogenase  27.5 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0989  glucose sorbosone dehydrogenase  26.8 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.41 
 
 
570 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.6 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0137  glucose sorbosone dehydrogenase  26.8 
 
 
386 aa  79  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  26.41 
 
 
374 aa  79  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3426  glucose sorbosone dehydrogenase  26.43 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  26.41 
 
 
374 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  50 
 
 
101 aa  78.2  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>