282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12748 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_12748  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  935    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.895209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2489  hypothetical protein  45.33 
 
 		 371 aa  286  4e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2666  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.47 
 
 		 388 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000177131  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.83 
 
 		 455 aa  278  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.101157 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0158  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.48 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2646  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.68 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0744943  normal  0.337363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.1 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2155  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.7 
 
 		 427 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567521 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1569  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.38 
 
 		 388 aa  259  9e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0485  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.7 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.335617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0959  hypothetical protein  43.51 
 
 		 419 aa  249  8e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2887  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.54 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0670261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1591  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.69 
 
 		 414 aa  238  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.391722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1830  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.2 
 
 		 442 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1540  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.62 
 
 		 403 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5756  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.85 
 
 		 460 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.62 
 
 		 570 aa  226  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6513  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.18 
 
 		 392 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.576185  normal  0.706231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0363  glucose sorbosone dehydrogenase  35.96 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.510495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4405  HHIPL1; HHIP-like 1  40 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0608136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1286  blue (type1) copper domain-containing protein  35.94 
 
 		 482 aa  190  5e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.185523  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0989  hypothetical protein  34.56 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1130  hypothetical protein  39.32 
 
 		 400 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  34.71 
 
 		 676 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0153  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.93 
 
 		 488 aa  172  9e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2694  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.62 
 
 		 520 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.439378  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  36.42 
 
 		 875 aa  163  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2375  glucose/sorbosone dehydrogenases-like  32.33 
 
 		 2172 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.842796  normal  0.181989 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1991  blue (type 1) copper domain protein  29.82 
 
 		 766 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1010  PKD domain-containing protein  36.36 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.234047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  35.76 
 
 		 1657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0140  hypothetical protein  33.24 
 
 		 469 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1249  PKD domain-containing protein  32.79 
 
 		 712 aa  143  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.8229  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.94 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  31.25 
 
 		 841 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0741  blue (type 1) copper domain protein  31.9 
 
 		 748 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2965  PKD domain-containing protein  33.76 
 
 		 1029 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651624  normal  0.0385802 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.33 
 
 		 972 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1913  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0779  PKD domain-containing protein  33.57 
 
 		 999 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0794  PKD domain-containing protein  33.57 
 
 		 999 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135837  normal  0.0870072 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5794  glucose sorbosone dehydrogenase  35.54 
 
 		 388 aa  114  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0465  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2521  glucose sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.21854  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3369  glucose sorbosone dehydrogenase  30.34 
 
 		 370 aa  113  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0775  PKD domain-containing protein  32.86 
 
 		 999 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482876  normal  0.807579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1440  glucose sorbosone dehydrogenase  31.03 
 
 		 530 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0303  hypothetical protein  31.19 
 
 		 518 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.743233  normal  0.644161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1315  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.986351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1511  glucose sorbosone dehydrogenase  30.06 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 		 1132 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2740  glucose sorbosone dehydrogenase  31.84 
 
 		 399 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3593  glucose sorbosone dehydrogenase  27.3 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 367 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.12 
 
 		 809 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1100  glucose sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 383 aa  106  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1937  carbohydrate-binding family 6 protein  33.2 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1294  glucose sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.298447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  30.92 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  30.92 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3928  glucose sorbosone dehydrogenase  30.8 
 
 		 387 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2208  PKD domain containing protein  30.34 
 
 		 908 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0778173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0542  glucose sorbosone dehydrogenase  29.06 
 
 		 385 aa  103  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4560  glucose sorbosone dehydrogenase  33.08 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.321101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0552  glucose sorbosone dehydrogenase  32.93 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.0000617979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6303  glucose sorbosone dehydrogenase  30.04 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0538  glucose sorbosone dehydrogenase  29.06 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4458  glucose sorbosone dehydrogenase  30.36 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1561  glucose sorbosone dehydrogenase  30.74 
 
 		 363 aa  101  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1796  glucose sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 		 392 aa  101  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.10437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0509  glucose sorbosone dehydrogenase  29.28 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.760601  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0814  glucose sorbosone dehydrogenase  26.47 
 
 		 462 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00498666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0474  glucose/sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1715  hypothetical protein  27.45 
 
 		 394 aa  100  7e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.296099  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4646  glucose sorbosone dehydrogenase  32.11 
 
 		 405 aa  99.8  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  30.51 
 
 		 1138 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1707  glucose sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 388 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.416986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1142  glucose sorbosone dehydrogenase  30.51 
 
 		 382 aa  99  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.320436  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2870  hypothetical protein  30.35 
 
 		 408 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2262  glucose sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 		 386 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.0609661 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2919  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.82 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000852444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0825  glucose sorbosone dehydrogenase  31.6 
 
 		 405 aa  97.4  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2581  hypothetical protein  28.8 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.132937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.39 
 
 		 729 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1791  hypothetical protein  30.49 
 
 		 411 aa  97.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00386684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3278  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 394 aa  97.4  5e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2435  hypothetical protein  27.31 
 
 		 476 aa  96.7  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0561908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2727  hypothetical protein  28.42 
 
 		 476 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2236  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.060795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2602  glucose sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436161  normal  0.21704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1322  glucose sorbosone dehydrogenase  36.26 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0828348  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1224  glucose sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  29.47 
 
 		 1182 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 		 892 aa  96.3  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4125  glucose sorbosone dehydrogenase  29.3 
 
 		 388 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.285901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2552  glucose sorbosone dehydrogenase  28.32 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0417  glucose sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000311026  hitchhiker  0.00936904 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2710  glucose sorbosone dehydrogenase  30.89 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>