75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0537 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  100 
 
 
1029 aa  2085    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  46.63 
 
 
757 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.54 
 
 
3191 aa  308  4.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  42.86 
 
 
1003 aa  156  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  40.19 
 
 
646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  40.91 
 
 
1668 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  41.08 
 
 
501 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  39.78 
 
 
1147 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  37.82 
 
 
324 aa  122  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  38.55 
 
 
1437 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  39.46 
 
 
394 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  37.24 
 
 
341 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  35.45 
 
 
495 aa  111  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  32.57 
 
 
491 aa  111  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  37.93 
 
 
408 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  37.64 
 
 
1433 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  36.41 
 
 
700 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  35.84 
 
 
1296 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  47.11 
 
 
333 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  38.79 
 
 
362 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  40.46 
 
 
541 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.64 
 
 
755 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
1773 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  36.36 
 
 
657 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  35.14 
 
 
803 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  38.46 
 
 
558 aa  100  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  38.04 
 
 
1055 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  35.29 
 
 
736 aa  98.6  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  40.59 
 
 
543 aa  98.6  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  29.65 
 
 
336 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  34.32 
 
 
371 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  30 
 
 
340 aa  93.6  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  34.9 
 
 
571 aa  92  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  32.6 
 
 
996 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.37 
 
 
1575 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.85 
 
 
570 aa  89.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.89 
 
 
688 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.93 
 
 
665 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  33.33 
 
 
428 aa  86.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  33.53 
 
 
1263 aa  84.3  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  50.55 
 
 
308 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.46 
 
 
1783 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  39.69 
 
 
221 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  33.13 
 
 
634 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  39.37 
 
 
1294 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  32.2 
 
 
477 aa  81.6  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.87 
 
 
1174 aa  81.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  28.43 
 
 
725 aa  80.5  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.82 
 
 
1797 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  28.07 
 
 
366 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.73 
 
 
933 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  31.48 
 
 
693 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  30.51 
 
 
523 aa  79.7  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.29 
 
 
1015 aa  78.6  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  35.8 
 
 
601 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.35 
 
 
900 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  32.58 
 
 
376 aa  76.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  29.85 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  31.18 
 
 
230 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.07 
 
 
1215 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  31.69 
 
 
571 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  32.16 
 
 
1087 aa  73.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  26.26 
 
 
846 aa  71.6  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  28.57 
 
 
1318 aa  71.2  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  29.84 
 
 
686 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 
728 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  31.21 
 
 
647 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  30.73 
 
 
254 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.27 
 
 
876 aa  65.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  29.41 
 
 
398 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  36.07 
 
 
367 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4265  hypothetical protein  26.98 
 
 
661 aa  54.3  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.9 
 
 
687 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  33.98 
 
 
701 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  29.06 
 
 
937 aa  44.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>