88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0726 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 1263 aa  2570    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1055 aa  325  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.04 
 
 		 1318 aa  292  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  27.39 
 
 		 1296 aa  206  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1215 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  36.54 
 
 		 308 aa  155  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  32.2 
 
 		 1332 aa  148  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  33.43 
 
 		 1294 aa  147  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  29.42 
 
 		 1526 aa  141  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  34.02 
 
 		 350 aa  131  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  37.17 
 
 		 417 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  29.24 
 
 		 799 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1010 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  36.09 
 
 		 852 aa  107  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  35.51 
 
 		 2192 aa  99  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  37.28 
 
 		 1092 aa  98.2  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  35.42 
 
 		 601 aa  94.7  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  34.46 
 
 		 324 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  26.88 
 
 		 507 aa  93.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.9 
 
 		 665 aa  90.1  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  34.29 
 
 		 1575 aa  84.7  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  31.79 
 
 		 408 aa  84.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  33.53 
 
 		 1029 aa  84.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.67 
 
 		 1437 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  34.18 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  32.6 
 
 		 686 aa  81.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  28.57 
 
 		 757 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  29.82 
 
 		 1106 aa  79.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  30.49 
 
 		 1433 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  32.74 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 1668 aa  75.1  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 		 743 aa  75.1  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.14 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  30.18 
 
 		 1003 aa  74.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  26.57 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.19 
 
 		 900 aa  72  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  31.25 
 
 		 558 aa  71.6  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  30 
 
 		 736 aa  71.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.04 
 
 		 1783 aa  70.5  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  27.33 
 
 		 634 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  28.74 
 
 		 495 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  31.03 
 
 		 646 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 1015 aa  68.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  30.91 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  30.73 
 
 		 996 aa  68.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  29.34 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  33.1 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  28.32 
 
 		 933 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.16 
 
 		 1797 aa  66.6  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 371 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  28.99 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  33.91 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  34.43 
 
 		 1147 aa  65.1  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  26.74 
 
 		 657 aa  64.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  34.31 
 
 		 254 aa  63.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  34.15 
 
 		 501 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  31.1 
 
 		 376 aa  62.4  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  25.45 
 
 		 1174 aa  61.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  27.91 
 
 		 1087 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  34.82 
 
 		 230 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.05 
 
 		 1773 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  24.86 
 
 		 728 aa  60.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  28.14 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  27.71 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  28.95 
 
 		 701 aa  58.9  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  32 
 
 		 876 aa  58.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  31.47 
 
 		 362 aa  57.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  26.17 
 
 		 1170 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  28 
 
 		 347 aa  56.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  31.14 
 
 		 700 aa  55.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  27.71 
 
 		 523 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  27.97 
 
 		 398 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  26.29 
 
 		 571 aa  54.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  27.66 
 
 		 541 aa  52.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  28.16 
 
 		 341 aa  53.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  25.75 
 
 		 725 aa  52  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  25.84 
 
 		 688 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  25.88 
 
 		 340 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  29.82 
 
 		 647 aa  50.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  27 
 
 		 1755 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.87 
 
 		 687 aa  49.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  27.47 
 
 		 366 aa  49.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  27.88 
 
 		 336 aa  48.9  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  25.44 
 
 		 693 aa  48.5  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  41.46 
 
 		 149 aa  47  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  27.54 
 
 		 394 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  32.56 
 
 		 5453 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  31.49 
 
 		 454 aa  45.1  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>