142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4272 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  100 
 
 		 852 aa  1633    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1788  polymorphic membrane protein  40.35 
 
 		 1092 aa  275  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1035  hypothetical protein  51.2 
 
 		 1010 aa  257  6e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  48.7 
 
 		 2192 aa  250  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1790  polymorphic membrane protein  42.65 
 
 		 799 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0327  conserved repeat domain protein  34.46 
 
 		 743 aa  211  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  37.16 
 
 		 1296 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  51.6 
 
 		 1902 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1875  polymorphic membrane protein  35.19 
 
 		 507 aa  178  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  33.96 
 
 		 1332 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2319  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1106 aa  146  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.300784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1921  hypothetical protein  35 
 
 		 350 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.884061  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0005  polymorphic outer membrane protein  29.7 
 
 		 775 aa  141  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000710623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  36.69 
 
 		 2194 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1920  hypothetical protein  38.06 
 
 		 417 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.409778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  36.83 
 
 		 1526 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  28.65 
 
 		 1170 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  29.24 
 
 		 1318 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2515  hypothetical protein  37.18 
 
 		 441 aa  121  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  29.43 
 
 		 1216 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  62.2 
 
 		 560 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  36.42 
 
 		 2886 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  36.42 
 
 		 1263 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3282  hypothetical protein  54.69 
 
 		 149 aa  110  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.290972  hitchhiker  0.000227158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  40.19 
 
 		 1424 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  35.55 
 
 		 1359 aa  105  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  35.65 
 
 		 3066 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.34 
 
 		 2802 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  34.24 
 
 		 1755 aa  99.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1055 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  34.12 
 
 		 3227 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.54 
 
 		 558 aa  92  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000300518 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  35.04 
 
 		 1428 aa  89.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  36.18 
 
 		 1699 aa  88.6  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2839 aa  82  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  43.62 
 
 		 828 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  30.56 
 
 		 4830 aa  80.9  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  30.56 
 
 		 3864 aa  80.9  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  30.03 
 
 		 7434 aa  79.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.68 
 
 		 2031 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1750 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  31.44 
 
 		 918 aa  76.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  31.4 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.25 
 
 		 2156 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  31.55 
 
 		 461 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  31.25 
 
 		 1196 aa  73.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  30.03 
 
 		 527 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  33.33 
 
 		 770 aa  72  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  35.29 
 
 		 1092 aa  71.2  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.34 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  33.5 
 
 		 466 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  47 
 
 		 2927 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32.86 
 
 		 483 aa  67.4  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15312  predicted protein  29.48 
 
 		 1359 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  23.47 
 
 		 591 aa  65.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  49.41 
 
 		 1191 aa  65.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  30.61 
 
 		 4480 aa  64.3  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  31.82 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  30.43 
 
 		 764 aa  62.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  29.68 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  29.76 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  42.74 
 
 		 2522 aa  62  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.15 
 
 		 767 aa  62  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  27.98 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  30.68 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  29.52 
 
 		 477 aa  59.3  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2253  polymorphic outer membrane protein  26.37 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0130989  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  31.91 
 
 		 819 aa  58.2  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1677  hypothetical protein  39.73 
 
 		 2233 aa  58.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  33.05 
 
 		 873 aa  57.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  29.83 
 
 		 846 aa  57.8  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  28 
 
 		 5453 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  28.96 
 
 		 777 aa  57  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  35.29 
 
 		 523 aa  57  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  34.56 
 
 		 759 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  30.39 
 
 		 1526 aa  56.6  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  31.63 
 
 		 575 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  28.34 
 
 		 361 aa  55.5  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  25.24 
 
 		 591 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  42.86 
 
 		 1848 aa  55.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  27.06 
 
 		 464 aa  55.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 		 5442 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  28.4 
 
 		 2042 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  40.52 
 
 		 3391 aa  55.1  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  33.14 
 
 		 509 aa  54.3  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  44.23 
 
 		 1202 aa  54.3  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  31.17 
 
 		 790 aa  53.9  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  27.16 
 
 		 465 aa  53.9  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  29.03 
 
 		 476 aa  53.9  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  29.81 
 
 		 860 aa  52.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  28.71 
 
 		 3925 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  32.35 
 
 		 763 aa  53.5  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  30.56 
 
 		 557 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0455  pectate lyase-related protein  30.83 
 
 		 563 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  29.38 
 
 		 3340 aa  52.8  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  30.14 
 
 		 454 aa  52.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  29.75 
 
 		 433 aa  52.8  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.78 
 
 		 2768 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  28.32 
 
 		 501 aa  52.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  30.23 
 
 		 468 aa  52  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>