54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3608 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 918 aa  1818    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.886331  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4139  outer membrane protein  86.43 
 
 		 764 aa  732    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.609816  normal  0.559542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1976  outer membrane protein  80.82 
 
 		 1196 aa  1164    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.839593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  65.29 
 
 		 7434 aa  941    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  62.86 
 
 		 4830 aa  827    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0378  outer membrane protein  70.18 
 
 		 860 aa  710    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906993  normal  0.228365 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  62.86 
 
 		 3864 aa  828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1980  outer membrane protein  74.13 
 
 		 768 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3205  hypothetical protein  59.52 
 
 		 873 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4145  hypothetical protein  62.06 
 
 		 756 aa  556  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.686732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4144  hypothetical protein  60.25 
 
 		 781 aa  554  1e-156  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1130  hypothetical protein  58.26 
 
 		 768 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.541884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4141  hypothetical protein  59.72 
 
 		 819 aa  545  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.580525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1978  outer membrane protein  63.43 
 
 		 770 aa  500  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.206942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3203  outer membrane protein  49.6 
 
 		 954 aa  487  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4344  hypothetical protein  54.07 
 
 		 846 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000873034  normal  0.549716 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1524  outer membrane protein  49.66 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.312083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4342  outer membrane protein  51.34 
 
 		 790 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.302573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.11 
 
 		 2156 aa  364  4e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  36.32 
 
 		 3066 aa  361  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4987  outer membrane protein  49.25 
 
 		 763 aa  348  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2587  outer membrane protein  39.59 
 
 		 889 aa  319  2e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00407649 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2037  hypothetical protein  53.42 
 
 		 308 aa  259  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.259898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  34.77 
 
 		 5442 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4242  outer membrane protein  37.28 
 
 		 3340 aa  234  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1526 aa  204  4e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2038  outer membrane protein  50 
 
 		 479 aa  176  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  39.69 
 
 		 4697 aa  174  7.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2034  outer membrane protein  50.44 
 
 		 465 aa  174  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.549347  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  31.62 
 
 		 2768 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2847  cadherin domain-containing protein  29.92 
 
 		 1699 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2781  outer membrane autotransporter  30.99 
 
 		 2886 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4997  outer membrane protein  33.72 
 
 		 4428 aa  110  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0251  outer membrane autotransporter  30.46 
 
 		 1359 aa  100  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0490823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1902 aa  98.6  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2848  hemagglutinin/hemolysin-related protein  28.24 
 
 		 4480 aa  90.1  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4431  outer membrane protein  33.24 
 
 		 2796 aa  90.1  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.876357  normal  0.690174 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  33.22 
 
 		 2839 aa  86.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2861  outer membrane protein  45.14 
 
 		 1641 aa  85.5  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  26.15 
 
 		 3227 aa  82.8  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 4678 aa  80.5  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2195  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1151 aa  80.1  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.175885  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  31.44 
 
 		 852 aa  75.5  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  45.26 
 
 		 2193 aa  69.7  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  32.16 
 
 		 2927 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2696  outer membrane autotransporter  27 
 
 		 2194 aa  68.2  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.533245 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  40 
 
 		 1827 aa  61.6  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4433  outer membrane protein  32.4 
 
 		 1099 aa  61.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  26.63 
 
 		 3146 aa  56.2  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.07 
 
 		 1627 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  24.59 
 
 		 3470 aa  52  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2849  RTX toxin-like protein  32.66 
 
 		 1092 aa  51.6  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  44.29 
 
 		 1586 aa  48.9  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  34 
 
 		 693 aa  46.6  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>