163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4251 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  100 
 
 		 2802 aa  5292    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  62.42 
 
 		 1848 aa  413  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.44 
 
 		 826 aa  350  2e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  52.27 
 
 		 1178 aa  348  6e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  56.05 
 
 		 1026 aa  345  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.12 
 
 		 810 aa  345  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.46 
 
 		 714 aa  342  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.27 
 
 		 1126 aa  340  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.21 
 
 		 1383 aa  335  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  51.68 
 
 		 920 aa  330  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.19 
 
 		 1507 aa  328  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  50.44 
 
 		 721 aa  325  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.13 
 
 		 540 aa  324  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.61 
 
 		 887 aa  321  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  51.92 
 
 		 1130 aa  318  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  56.93 
 
 		 633 aa  317  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  50.89 
 
 		 1255 aa  313  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.72 
 
 		 1607 aa  312  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.48 
 
 		 805 aa  311  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  45.32 
 
 		 1176 aa  309  4.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  48.84 
 
 		 884 aa  308  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  51.94 
 
 		 1221 aa  308  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  51.75 
 
 		 701 aa  307  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 		 1195 aa  304  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  54.51 
 
 		 1285 aa  304  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.04 
 
 		 408 aa  300  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  50 
 
 		 640 aa  300  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.71 
 
 		 1183 aa  289  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  46.8 
 
 		 664 aa  289  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.63 
 
 		 1176 aa  281  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.59 
 
 		 1292 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  43.24 
 
 		 462 aa  281  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  56.08 
 
 		 3089 aa  279  6e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  44.08 
 
 		 862 aa  276  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  50.49 
 
 		 933 aa  271  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  47.06 
 
 		 791 aa  267  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  68.1 
 
 		 3391 aa  263  2e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  47.09 
 
 		 3563 aa  258  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.71 
 
 		 3066 aa  236  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  43.33 
 
 		 3227 aa  236  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  46.62 
 
 		 648 aa  234  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  44.47 
 
 		 3544 aa  207  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.52 
 
 		 3699 aa  207  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  41.29 
 
 		 3699 aa  207  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  43.53 
 
 		 288 aa  206  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  40.65 
 
 		 2503 aa  204  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  47.69 
 
 		 2192 aa  190  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6371  hypothetical protein  30.67 
 
 		 3736 aa  176  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6074  hypothetical protein  29.65 
 
 		 3734 aa  171  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  47.22 
 
 		 1083 aa  168  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  43.92 
 
 		 3477 aa  147  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0160  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.29 
 
 		 2156 aa  122  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  46.5 
 
 		 1869 aa  121  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01455  cell wall associated biofilm protein  50.74 
 
 		 3089 aa  120  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  47.57 
 
 		 1439 aa  119  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  48.05 
 
 		 2207 aa  115  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 1855 aa  109  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0470  Ig family protein  38.51 
 
 		 2853 aa  109  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0565  Ig family protein  35.8 
 
 		 2820 aa  108  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.45 
 
 		 3323 aa  108  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  36.59 
 
 		 3954 aa  108  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0482  Ig family protein  38.79 
 
 		 2132 aa  108  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  33.33 
 
 		 1838 aa  107  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.61 
 
 		 14916 aa  106  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.53 
 
 		 4334 aa  103  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0392  Ig family protein  36.46 
 
 		 2001 aa  100  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  47.59 
 
 		 852 aa  99.8  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.29 
 
 		 3363 aa  99  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  28.83 
 
 		 7149 aa  99  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3182  putative outer membrane adhesin-like protein  32.26 
 
 		 3132 aa  98.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1657 aa  96.3  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1357  outer membrane protein  27.18 
 
 		 4830 aa  94.7  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.381537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4143  outer membrane protein  27.18 
 
 		 3864 aa  94.4  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.42 
 
 		 2133 aa  92.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  27.48 
 
 		 5444 aa  90.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4419  hypothetical protein  33.78 
 
 		 922 aa  89.7  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  35.06 
 
 		 3508 aa  89.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.77 
 
 		 6678 aa  89.4  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  67.11 
 
 		 2636 aa  89  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  40.13 
 
 		 3714 aa  89  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1974  hypothetical protein  26.9 
 
 		 7434 aa  87.8  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  34.55 
 
 		 16311 aa  87  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3233  hypothetical protein  28.77 
 
 		 4465 aa  85.9  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.226873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1339  Hemolysin-type calcium-binding region  32.98 
 
 		 8980 aa  84.7  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  29.09 
 
 		 2911 aa  84  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  40.35 
 
 		 2927 aa  83.2  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.76 
 
 		 1019 aa  83.2  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 		 6779 aa  83.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 		 6662 aa  83.2  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.96 
 
 		 6683 aa  83.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1239  VCBS  35.19 
 
 		 2461 aa  82  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.4 
 
 		 5216 aa  82.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  40.71 
 
 		 824 aa  82  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.05 
 
 		 1143 aa  81.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1952  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1538 aa  80.9  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4605  putative Ig domain family protein  28.25 
 
 		 5561 aa  80.9  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.94 
 
 		 3204 aa  80.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  48.39 
 
 		 2522 aa  78.2  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4520  putative Ig domain protein  29.18 
 
 		 5561 aa  78.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  65.12 
 
 		 2042 aa  78.6  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>