60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3660 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  100 
 
 
791 aa  1595    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.96 
 
 
1383 aa  304  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  48.32 
 
 
1292 aa  298  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.7 
 
 
1507 aa  297  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.39 
 
 
826 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.85 
 
 
1607 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  49.02 
 
 
1848 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.04 
 
 
714 aa  280  9e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.48 
 
 
1221 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  45.48 
 
 
1026 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.45 
 
 
810 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  48.78 
 
 
1195 aa  276  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  42.09 
 
 
721 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.25 
 
 
1183 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.85 
 
 
1126 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  47.06 
 
 
2802 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.51 
 
 
1130 aa  268  4e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  44.59 
 
 
633 aa  266  1e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  41.49 
 
 
540 aa  265  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.33 
 
 
805 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  43.65 
 
 
920 aa  257  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  43.82 
 
 
1178 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  45.59 
 
 
701 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  43.48 
 
 
862 aa  255  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.64 
 
 
887 aa  247  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  49.64 
 
 
1285 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  44.25 
 
 
884 aa  243  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  43.13 
 
 
1255 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.88 
 
 
1176 aa  236  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  42.33 
 
 
462 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.5 
 
 
664 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  49.29 
 
 
1176 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  39.63 
 
 
408 aa  231  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  43.29 
 
 
640 aa  230  8e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  48.05 
 
 
648 aa  215  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  42.42 
 
 
933 aa  208  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  45.42 
 
 
288 aa  199  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  39.17 
 
 
3563 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  46.06 
 
 
1083 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  24.28 
 
 
443 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  24.37 
 
 
596 aa  101  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  22.87 
 
 
476 aa  95.9  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  21.84 
 
 
513 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  23.08 
 
 
423 aa  55.5  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  21.69 
 
 
503 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  19.7 
 
 
473 aa  54.3  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1495  S41 family peptidase  19.54 
 
 
365 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0882009  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6647  peptidase S41  29.05 
 
 
488 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.236237 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1284  S41 family peptidase  19.75 
 
 
365 aa  53.5  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.571136  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0218  hypothetical protein  19.01 
 
 
426 aa  51.6  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  29.28 
 
 
472 aa  51.6  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  32.5 
 
 
452 aa  48.5  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  21.81 
 
 
491 aa  48.1  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4634  carboxyl-terminal protease  26.42 
 
 
709 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0425581  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25.47 
 
 
1092 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3517  peptidase S41  26 
 
 
432 aa  44.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0636352  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  25.61 
 
 
1104 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 
447 aa  44.3  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.22 
 
 
1065 aa  44.3  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  25.43 
 
 
446 aa  44.3  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>