83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2256 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
1183 aa  2344    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.69 
 
 
3563 aa  484  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  30 
 
 
1176 aa  357  7.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.41 
 
 
1221 aa  341  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.96 
 
 
887 aa  340  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.14 
 
 
1383 aa  330  7e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  51.49 
 
 
1195 aa  330  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50 
 
 
714 aa  324  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.12 
 
 
810 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.15 
 
 
826 aa  317  6e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.12 
 
 
540 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  49.13 
 
 
1026 aa  313  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.36 
 
 
1126 aa  308  5.0000000000000004e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  50.61 
 
 
1848 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.84 
 
 
633 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  46.38 
 
 
721 aa  301  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  49.58 
 
 
1255 aa  300  8e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53 
 
 
805 aa  300  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.96 
 
 
1607 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  47.73 
 
 
884 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  45.56 
 
 
920 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.95 
 
 
1130 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.35 
 
 
408 aa  288  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  44 
 
 
1292 aa  288  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  47.77 
 
 
2802 aa  286  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  44.03 
 
 
1178 aa  285  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.48 
 
 
701 aa  280  8e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  42.86 
 
 
1507 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  55.21 
 
 
1285 aa  276  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  45.5 
 
 
640 aa  275  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  46.57 
 
 
862 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  46.25 
 
 
791 aa  271  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  48.08 
 
 
933 aa  260  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  41.35 
 
 
664 aa  259  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  43.37 
 
 
462 aa  257  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.54 
 
 
1176 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  30.94 
 
 
1280 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  31.88 
 
 
1991 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  42.48 
 
 
648 aa  216  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  29.63 
 
 
1027 aa  190  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  43.7 
 
 
288 aa  183  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0361  hypothetical protein  26.85 
 
 
857 aa  169  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.687552  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  45.62 
 
 
1083 aa  167  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.99 
 
 
1585 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  26.16 
 
 
1588 aa  128  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  30.55 
 
 
858 aa  105  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  31.81 
 
 
2198 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3915  hypothetical protein  28.62 
 
 
1100 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.341556  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  29.8 
 
 
901 aa  95.5  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  28.84 
 
 
889 aa  95.1  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  30.51 
 
 
864 aa  93.2  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.08 
 
 
2807 aa  93.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  28.93 
 
 
1933 aa  90.1  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1784  hypothetical protein  27.78 
 
 
523 aa  89.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  24.05 
 
 
8871 aa  86.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  33.1 
 
 
665 aa  86.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.75 
 
 
2467 aa  71.6  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.55 
 
 
1454 aa  71.2  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.26 
 
 
1523 aa  69.3  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  29.77 
 
 
661 aa  64.7  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  35.06 
 
 
646 aa  64.3  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  32.43 
 
 
1550 aa  62.4  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2590  hypothetical protein  26.73 
 
 
429 aa  62  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.105703 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  37.5 
 
 
2003 aa  62  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  28.12 
 
 
14944 aa  61.6  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2420  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 
429 aa  60.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  30.69 
 
 
1132 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  24.79 
 
 
1068 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  32.93 
 
 
425 aa  55.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  40.16 
 
 
683 aa  53.5  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  36.71 
 
 
1362 aa  53.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  33.56 
 
 
403 aa  52.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5021  hypothetical protein  24.27 
 
 
569 aa  51.6  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196755  normal  0.0476496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  26.9 
 
 
1134 aa  50.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  26.01 
 
 
943 aa  51.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  38.68 
 
 
1916 aa  50.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  23.4 
 
 
888 aa  49.3  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  28.61 
 
 
734 aa  48.5  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  30.07 
 
 
1140 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.57 
 
 
1565 aa  47.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28.03 
 
 
1976 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.37 
 
 
696 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  28.4 
 
 
716 aa  45.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>