66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3823 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  100 
 
 
1255 aa  2539    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  56.48 
 
 
540 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  58.67 
 
 
920 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  58.24 
 
 
721 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  55.06 
 
 
408 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  57.53 
 
 
714 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  53.66 
 
 
640 aa  383  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.5 
 
 
826 aa  371  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  58.31 
 
 
810 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  55.53 
 
 
805 aa  370  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  55.71 
 
 
1026 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  55.4 
 
 
1178 aa  357  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  51.67 
 
 
884 aa  352  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  54.4 
 
 
633 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  53.98 
 
 
1126 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  54.39 
 
 
1607 aa  341  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.63 
 
 
1383 aa  338  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.47 
 
 
664 aa  338  5e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  52.62 
 
 
701 aa  332  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  52.96 
 
 
1195 aa  324  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  50.89 
 
 
2802 aa  321  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  47.38 
 
 
1221 aa  318  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  51.2 
 
 
3563 aa  314  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.55 
 
 
1507 aa  313  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.58 
 
 
1183 aa  313  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0030  hypothetical protein  29.47 
 
 
875 aa  311  6.999999999999999e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0193988 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  48.6 
 
 
1848 aa  309  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  45.82 
 
 
1176 aa  296  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  53 
 
 
1285 aa  295  3e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.8 
 
 
1130 aa  295  4e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2143  hypothetical protein  29.99 
 
 
871 aa  295  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.476664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.94 
 
 
887 aa  281  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.15 
 
 
1176 aa  256  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  45.4 
 
 
1292 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  43.13 
 
 
791 aa  248  6.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  44.64 
 
 
862 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  41.11 
 
 
462 aa  229  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  43.98 
 
 
933 aa  225  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  42.61 
 
 
648 aa  201  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  37.22 
 
 
288 aa  153  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  40.85 
 
 
1083 aa  129  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2585  hypothetical protein  29.44 
 
 
866 aa  89  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3130  hypothetical protein  28.14 
 
 
868 aa  84.7  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2725  hypothetical protein  28.85 
 
 
866 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0192734  normal  0.825712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2915  hypothetical protein  27.01 
 
 
866 aa  75.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4360  hypothetical protein  31.53 
 
 
719 aa  74.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0384  hypothetical protein  24.53 
 
 
730 aa  73.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.228891  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1722  hypothetical protein  26.4 
 
 
774 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1746  hypothetical protein  26.4 
 
 
774 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.333719  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  30.46 
 
 
1414 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
641 aa  60.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.08 
 
 
883 aa  57.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 
1184 aa  55.5  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1257  carbohydrate-binding, CenC-like protein  30.17 
 
 
1050 aa  55.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.41 
 
 
1694 aa  53.5  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  31.06 
 
 
14944 aa  53.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 
642 aa  53.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  42.42 
 
 
2003 aa  53.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.67 
 
 
1321 aa  52  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  30.53 
 
 
1362 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.97 
 
 
627 aa  48.5  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  23.63 
 
 
927 aa  48.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2878  histidine kinase  29.68 
 
 
968 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.799361  normal  0.0181006 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  28.36 
 
 
1550 aa  46.6  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  29.8 
 
 
1918 aa  46.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1826  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.47 
 
 
206 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.362999  normal  0.34813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>