54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5002 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  100 
 
 		 443 aa  919    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  23.43 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  25.65 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  24.46 
 
 		 791 aa  117  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  24.28 
 
 		 503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  25.37 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  21.45 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  22.22 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0632  C-terminal processing peptidase-1  31.45 
 
 		 705 aa  59.7  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.366246 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  22.18 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 		 428 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2226  peptidase S41  21.68 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0557  peptidase S41  22 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.378494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.09 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.13 
 
 		 431 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 429 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  22.37 
 
 		 691 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0730  peptidase S41  22.22 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.926608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2023  peptidase S41  32.38 
 
 		 337 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0328  hypothetical protein  26.39 
 
 		 682 aa  50.4  0.00007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00617065  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  19.8 
 
 		 491 aa  50.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2491  carboxyl-terminal protease  25.11 
 
 		 721 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5799  peptidase S41  31.62 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0956091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  21.3 
 
 		 394 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 		 436 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  26.7 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0877  carboxyl-terminal protease  27.74 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1935  carboxy-terminal protease  28.99 
 
 		 681 aa  47.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.487036  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  27.41 
 
 		 440 aa  47.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2187  carboxy-terminal protease  30.41 
 
 		 664 aa  47  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.596133  normal  0.445771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  27.33 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  26.29 
 
 		 560 aa  47  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0240  hypothetical protein  27.86 
 
 		 656 aa  46.6  0.0008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  unclonable  0.000497427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  29.11 
 
 		 421 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  24.22 
 
 		 446 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  24.24 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  25.44 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  31.29 
 
 		 694 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  32.38 
 
 		 518 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  30.7 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  34.23 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02002  carboxy-terminal protease  29.85 
 
 		 680 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373627  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1046  carboxyl-terminal protease  27.93 
 
 		 693 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000142201  unclonable  0.00000192026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2133  carboxy-terminal protease  28.99 
 
 		 690 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000755516  normal  0.0766103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2483  carboxy-terminal protease  29.71 
 
 		 690 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000106803  normal  0.0256948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2561  C-terminal processing peptidase  21.96 
 
 		 676 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  30.28 
 
 		 697 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2089  peptidase S41  27.49 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0444891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00358  peptidase, S41 family  31.13 
 
 		 348 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0705784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  27.13 
 
 		 550 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1363  carboxyl-terminal protease  28.66 
 
 		 688 aa  43.5  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  22.31 
 
 		 692 aa  43.1  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6521  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 		 709 aa  43.5  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>