19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1240 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  100 
 
 
491 aa  994    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  21.81 
 
 
473 aa  94.4  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  23.25 
 
 
476 aa  84  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  20.9 
 
 
428 aa  62.8  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6149  peptidase S41  22.54 
 
 
513 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.451646  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  21.49 
 
 
503 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3843  peptidase S41  22.3 
 
 
596 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.140508  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 
489 aa  48.5  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  20.41 
 
 
494 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  21.81 
 
 
791 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  38 
 
 
443 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0277  peptidase S41  29.61 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1328  C-terminal processing peptidase-1  37.11 
 
 
694 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0242336  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
377 aa  44.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 
379 aa  44.7  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2810  carboxy-terminal protease  36.96 
 
 
683 aa  44.3  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0215017  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1304  C-terminal processing peptidase-1  32.2 
 
 
680 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1252  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 
697 aa  44.3  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14975  peptidase S41  30.49 
 
 
162 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000269348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>