122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2171 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2171  peptidase S41  100 
 
 		 473 aa  973    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1240  peptidase S41  21.81 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376394  normal  0.0173167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5254  peptidase S41  21.65 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000438932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  22.75 
 
 		 445 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5002  peptidase S41  21.45 
 
 		 443 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0902927  normal  0.0318245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  26.82 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  23.03 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  24.23 
 
 		 401 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  25.82 
 
 		 439 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  23.34 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  23.17 
 
 		 438 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 437 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  24.32 
 
 		 468 aa  56.2  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  25.59 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 468 aa  55.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  23.55 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  22.93 
 
 		 439 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  20.26 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  23.18 
 
 		 710 aa  54.7  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  25.7 
 
 		 439 aa  54.3  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  19.7 
 
 		 791 aa  54.3  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  24.77 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  23.57 
 
 		 415 aa  53.9  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  23.7 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  32.35 
 
 		 446 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  24.17 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  26.51 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  24.17 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  22.97 
 
 		 551 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0408  peptidase S41  22.37 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1099  peptidase S41  20.44 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.257556  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  23.01 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  22.92 
 
 		 443 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  26.51 
 
 		 444 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  22.05 
 
 		 397 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  23.94 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  25.24 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  26.15 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  26.15 
 
 		 445 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 535 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2484  hypothetical protein  21.83 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00164031  normal  0.011606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0049  C-terminal processing peptidase-3  26.79 
 
 		 401 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000124234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  24.37 
 
 		 479 aa  49.3  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  21.88 
 
 		 459 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  26.32 
 
 		 401 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  26.79 
 
 		 401 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  22.01 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  23.72 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  22.86 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  29.28 
 
 		 477 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  22.27 
 
 		 446 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  24.66 
 
 		 418 aa  47.8  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3885  tail-specific protease  25.7 
 
 		 693 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455139  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  28.16 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 515 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  23.5 
 
 		 456 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  22.69 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1599  peptidase S41A, C-terminal protease  26.05 
 
 		 704 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0464892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  23.5 
 
 		 456 aa  47.4  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0724  hypothetical protein  25.21 
 
 		 434 aa  47  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.754516  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 550 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1311  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 		 693 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1719  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0889073  normal  0.0338124 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 436 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  23.9 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  29.33 
 
 		 394 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  22.54 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4000  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 		 704 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00109251  normal  0.679688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  22.54 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1268  carboxyl-terminal protease  26.24 
 
 		 693 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000748265  normal  0.0247488 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  21.49 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  20.78 
 
 		 476 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  23.11 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  25.23 
 
 		 458 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0703  carboxyl-terminal protease  19.48 
 
 		 437 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  24.89 
 
 		 532 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1679  C-terminal processing peptidase-1  26.6 
 
 		 705 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  24.2 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  25.47 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  26.47 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  23.64 
 
 		 424 aa  45.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  23.9 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  22.86 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  23.64 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  23 
 
 		 462 aa  45.1  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 513 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  25.12 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  23.25 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 511 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  24.25 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>