More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0303 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  69.85 
 
 
530 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  80.43 
 
 
549 aa  803    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  68.96 
 
 
477 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  69.85 
 
 
524 aa  701    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  100 
 
 
532 aa  1073    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  69.85 
 
 
524 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  69.85 
 
 
530 aa  700    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  68.21 
 
 
515 aa  701    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  80.88 
 
 
538 aa  818    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  69.85 
 
 
524 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  69.17 
 
 
477 aa  666    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  70.27 
 
 
515 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  68.37 
 
 
530 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  69.85 
 
 
524 aa  701    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  70.27 
 
 
521 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  67.12 
 
 
526 aa  694    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  89.33 
 
 
535 aa  886    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  66.29 
 
 
522 aa  697    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  70.02 
 
 
511 aa  682    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  70.27 
 
 
515 aa  686    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  70.69 
 
 
515 aa  686    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  70.06 
 
 
513 aa  685    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  70.27 
 
 
515 aa  686    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  78.77 
 
 
550 aa  818    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  69.85 
 
 
524 aa  700    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  59.75 
 
 
479 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  58.46 
 
 
479 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  57.56 
 
 
478 aa  534  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  57.08 
 
 
479 aa  529  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  56.73 
 
 
481 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  56.25 
 
 
478 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  55.14 
 
 
480 aa  521  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  56.67 
 
 
478 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  56.67 
 
 
478 aa  513  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  52.83 
 
 
490 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  51.23 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  52.37 
 
 
482 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  48.65 
 
 
480 aa  441  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.42 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50.43 
 
 
468 aa  434  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  55.15 
 
 
483 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.7 
 
 
439 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.48 
 
 
432 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.19 
 
 
441 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.53 
 
 
426 aa  359  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
438 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
438 aa  346  7e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  46.28 
 
 
437 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  45.62 
 
 
436 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 
438 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 
438 aa  343  5e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.99 
 
 
436 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.72 
 
 
428 aa  343  7e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.17 
 
 
445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  44.22 
 
 
445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.5 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  47.59 
 
 
439 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  47.87 
 
 
439 aa  333  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.79 
 
 
439 aa  332  7.000000000000001e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  47.75 
 
 
468 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.31 
 
 
482 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.31 
 
 
482 aa  329  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  46.08 
 
 
462 aa  329  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  48.33 
 
 
445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  48.33 
 
 
445 aa  328  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.21 
 
 
455 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.39 
 
 
450 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  44.73 
 
 
443 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 
471 aa  320  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  45.08 
 
 
440 aa  319  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  44.58 
 
 
444 aa  317  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.88 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.12 
 
 
444 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.26 
 
 
440 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  46.81 
 
 
440 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 
458 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  48.42 
 
 
415 aa  312  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  44.09 
 
 
444 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  44.02 
 
 
443 aa  310  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  44.55 
 
 
433 aa  310  4e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  48.58 
 
 
457 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 
452 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  44.22 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  44.14 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.13 
 
 
423 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 
410 aa  307  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  43.54 
 
 
440 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  41.41 
 
 
445 aa  307  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  44.94 
 
 
445 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  43.54 
 
 
440 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 
440 aa  306  6e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
461 aa  306  7e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.78 
 
 
441 aa  306  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  46.13 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  44.16 
 
 
452 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  47.55 
 
 
451 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  45.6 
 
 
442 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  43.06 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>