More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3471 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 710 aa  1450    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0662  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 		 547 aa  279  1e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 451 aa  207  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.31 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.92 
 
 		 423 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  37.46 
 
 		 451 aa  204  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 458 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 379 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  40.67 
 
 		 447 aa  200  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 		 457 aa  200  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 		 456 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  39.86 
 
 		 425 aa  199  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.47 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  40.55 
 
 		 428 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1489  carboxyl-terminal protease  36.1 
 
 		 489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  38.96 
 
 		 430 aa  197  7e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 445 aa  197  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 		 428 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  40.2 
 
 		 445 aa  195  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.24 
 
 		 443 aa  194  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  39.13 
 
 		 434 aa  194  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 452 aa  193  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  38.13 
 
 		 424 aa  193  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  39.93 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 442 aa  193  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.05 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  38.13 
 
 		 424 aa  192  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.41 
 
 		 439 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.14 
 
 		 443 aa  192  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 		 472 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  38.08 
 
 		 438 aa  190  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 		 452 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  38.13 
 
 		 428 aa  189  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  37.1 
 
 		 444 aa  189  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 		 426 aa  188  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  38 
 
 		 445 aa  187  4e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 457 aa  188  4e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 444 aa  187  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.33 
 
 		 429 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.76 
 
 		 443 aa  187  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  38 
 
 		 449 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 441 aa  187  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  35.52 
 
 		 453 aa  187  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 448 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  38.33 
 
 		 448 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  39.13 
 
 		 446 aa  187  8e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 440 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  38.64 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  38.26 
 
 		 431 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 440 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.6 
 
 		 463 aa  185  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  38.46 
 
 		 444 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 472 aa  184  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 		 430 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 		 430 aa  184  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 506 aa  184  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.58 
 
 		 445 aa  183  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.58 
 
 		 445 aa  183  8.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  40 
 
 		 475 aa  183  8.000000000000001e-45  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  41.78 
 
 		 564 aa  183  9.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  37.29 
 
 		 439 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  36.88 
 
 		 440 aa  183  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.59 
 
 		 445 aa  183  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  37.11 
 
 		 427 aa  183  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  36.67 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 440 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 		 409 aa  182  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 440 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 383 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  37.29 
 
 		 398 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 		 440 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.09 
 
 		 468 aa  182  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  38.54 
 
 		 428 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.44 
 
 		 439 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 438 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07361  carboxyl-terminal processing protease  34.66 
 
 		 434 aa  182  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00775451 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.8 
 
 		 438 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 		 446 aa  181  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.59 
 
 		 445 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  36.33 
 
 		 446 aa  181  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 432 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 440 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  36.33 
 
 		 441 aa  180  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 437 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0110  C-terminal processing peptidase-2  34.36 
 
 		 434 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.196179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  39.87 
 
 		 563 aa  180  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  36.81 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  37.16 
 
 		 407 aa  179  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 		 423 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  35.9 
 
 		 482 aa  179  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 		 458 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>