More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0055 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  100 
 
 		 463 aa  930    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  63.99 
 
 		 462 aa  552  1e-156  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  59.87 
 
 		 449 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  53.01 
 
 		 440 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 		 444 aa  365  1e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  49.5 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 448 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  48.25 
 
 		 445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.7 
 
 		 445 aa  352  8e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  48.99 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  48.19 
 
 		 449 aa  350  3e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  48.85 
 
 		 442 aa  348  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  46.3 
 
 		 440 aa  345  7e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  46.57 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50.68 
 
 		 424 aa  345  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  51 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  51.29 
 
 		 451 aa  344  2e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.73 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  50.57 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.55 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  51.15 
 
 		 458 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  45.21 
 
 		 432 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  50.29 
 
 		 456 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  50.43 
 
 		 452 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  49.33 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.05 
 
 		 440 aa  333  4e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  49.71 
 
 		 457 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.44 
 
 		 440 aa  332  8e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  50.29 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  46.08 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.57 
 
 		 444 aa  329  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  44.81 
 
 		 446 aa  329  8e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  48 
 
 		 447 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  46.29 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.43 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  46.23 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 		 446 aa  326  5e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.81 
 
 		 461 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  45.52 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  45.52 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 438 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  40.18 
 
 		 457 aa  323  4e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.56 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  47.35 
 
 		 445 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.01 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  47.01 
 
 		 463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.88 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.44 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.22 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  44.58 
 
 		 462 aa  316  6e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  44.64 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  47.65 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  48.71 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  43.22 
 
 		 444 aa  314  2.9999999999999996e-84  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  47.69 
 
 		 472 aa  310  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 438 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  42.58 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.96 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  44.99 
 
 		 522 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  44.99 
 
 		 526 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.74 
 
 		 440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  44.07 
 
 		 444 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  46.33 
 
 		 498 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  43.4 
 
 		 452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  42.32 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  41.21 
 
 		 479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  46.78 
 
 		 507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  45.66 
 
 		 482 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  39.5 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  45.01 
 
 		 481 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 		 478 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  40.6 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.42 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  44.44 
 
 		 530 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  42.38 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  44.83 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.82 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  40.59 
 
 		 480 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  42.96 
 
 		 521 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  41.85 
 
 		 479 aa  299  8e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  42.36 
 
 		 480 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 476 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  42.06 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  42.71 
 
 		 530 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>