More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4209 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 440 aa  875    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  83.26 
 
 		 440 aa  743    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  81.28 
 
 		 444 aa  738    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  71.36 
 
 		 444 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  99.55 
 
 		 440 aa  872    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  70.88 
 
 		 442 aa  628  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  72.81 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  72.81 
 
 		 424 aa  616  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  67.36 
 
 		 434 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  63.62 
 
 		 440 aa  544  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  63.15 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  60.57 
 
 		 453 aa  536  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  59.96 
 
 		 458 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  60.31 
 
 		 456 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  61.5 
 
 		 446 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  60.54 
 
 		 447 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  61.5 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  58.93 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  61.27 
 
 		 440 aa  521  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  61.5 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  60.65 
 
 		 457 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  58.26 
 
 		 452 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  62.35 
 
 		 451 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  61.96 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  59.62 
 
 		 445 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  58.7 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  59.65 
 
 		 444 aa  483  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  54.29 
 
 		 471 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  56.23 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  51.49 
 
 		 441 aa  426  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  50.79 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  53.56 
 
 		 445 aa  422  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  53.33 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  53.09 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  48.19 
 
 		 449 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  51.13 
 
 		 462 aa  380  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  55.43 
 
 		 472 aa  379  1e-104  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  48.72 
 
 		 463 aa  373  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.88 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50.9 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 		 432 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.92 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 428 aa  360  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  53.03 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  49.74 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 438 aa  359  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.28 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  49.36 
 
 		 439 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.8 
 
 		 443 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.76 
 
 		 439 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.11 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.79 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  48 
 
 		 449 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  50.13 
 
 		 462 aa  351  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 468 aa  350  3e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.85 
 
 		 445 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.84 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  48.84 
 
 		 436 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.6 
 
 		 480 aa  348  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 		 446 aa  348  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.74 
 
 		 445 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.74 
 
 		 445 aa  348  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  47.85 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.89 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  45.96 
 
 		 437 aa  343  2.9999999999999997e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  45.31 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.14 
 
 		 455 aa  340  4e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.39 
 
 		 444 aa  339  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  43.47 
 
 		 468 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.63 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  47.44 
 
 		 463 aa  332  7.000000000000001e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.08 
 
 		 481 aa  329  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  44.4 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  45.48 
 
 		 426 aa  323  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  45.07 
 
 		 498 aa  320  3.9999999999999996e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  45.62 
 
 		 446 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  43.49 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  43.49 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  44.01 
 
 		 450 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  44.77 
 
 		 507 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  45.29 
 
 		 477 aa  310  4e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  44.5 
 
 		 477 aa  305  7e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  39.72 
 
 		 435 aa  305  7e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 515 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.55 
 
 		 530 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.55 
 
 		 457 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 437 aa  303  5.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 513 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  43.91 
 
 		 444 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  45.05 
 
 		 515 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  45.24 
 
 		 511 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 538 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>