More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0414 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  100 
 
 		 423 aa  850    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  88.65 
 
 		 451 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  87.85 
 
 		 457 aa  749    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  88.68 
 
 		 452 aa  763    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  89.46 
 
 		 456 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  90.31 
 
 		 451 aa  780    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  88.34 
 
 		 458 aa  756    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  72.51 
 
 		 440 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  73.89 
 
 		 440 aa  609  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  72.22 
 
 		 446 aa  609  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  73.4 
 
 		 440 aa  609  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  72.26 
 
 		 440 aa  608  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  72.26 
 
 		 440 aa  608  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  72.05 
 
 		 453 aa  606  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  72.13 
 
 		 447 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  71.5 
 
 		 445 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  73.62 
 
 		 444 aa  585  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  63.35 
 
 		 444 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  61.72 
 
 		 444 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  61.96 
 
 		 440 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  61.96 
 
 		 440 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  62.04 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  62.04 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  61.98 
 
 		 440 aa  500  1e-140  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  60.83 
 
 		 442 aa  492  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  59.42 
 
 		 444 aa  487  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  60.85 
 
 		 434 aa  474  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  59.5 
 
 		 440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  56.31 
 
 		 471 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  55.24 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  58.61 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  56.51 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  56.51 
 
 		 448 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  58.92 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  57.81 
 
 		 445 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  56.27 
 
 		 432 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.65 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  54.5 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  54.5 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  54.5 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 		 461 aa  389  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  51.22 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  53.54 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  53.89 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  52.7 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  52.59 
 
 		 462 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  54.7 
 
 		 462 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  52.17 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  53.37 
 
 		 468 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.72 
 
 		 480 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  56.92 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.76 
 
 		 476 aa  369  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  52.65 
 
 		 472 aa  368  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  52.21 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  49.88 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  53.76 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 452 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  51.21 
 
 		 457 aa  364  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  52.17 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  48.61 
 
 		 437 aa  364  2e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  48.03 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.64 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  51.29 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 		 455 aa  360  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  51.29 
 
 		 436 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  47.39 
 
 		 444 aa  359  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.64 
 
 		 439 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.9 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  52.57 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  50.78 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  50.78 
 
 		 445 aa  355  7.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  51.76 
 
 		 483 aa  354  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  54.6 
 
 		 445 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.78 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  49.33 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  49.33 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.63 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 444 aa  342  5e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 		 440 aa  342  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  50.57 
 
 		 463 aa  342  9e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  51.61 
 
 		 450 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  48.23 
 
 		 479 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  47.75 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  47.63 
 
 		 477 aa  329  7e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 		 481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  49.44 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  47.01 
 
 		 455 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  47.31 
 
 		 478 aa  327  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  47.63 
 
 		 480 aa  325  6e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  50.29 
 
 		 422 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  51.17 
 
 		 479 aa  325  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  49.47 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  48.94 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  49.47 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.31 
 
 		 457 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  48.94 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  48.94 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>