More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1437 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 429 aa  865    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  62.94 
 
 		 428 aa  558  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  63.16 
 
 		 433 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  58.47 
 
 		 443 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  55.94 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  52.09 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.55 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  45.45 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  43.65 
 
 		 443 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  44.83 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.85 
 
 		 441 aa  353  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 		 440 aa  352  1e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.83 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.5 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  47.01 
 
 		 436 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 		 436 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 455 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 		 432 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  43.11 
 
 		 461 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.22 
 
 		 450 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.84 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  46.37 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.46 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  46.8 
 
 		 426 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  43.74 
 
 		 444 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.65 
 
 		 446 aa  332  7.000000000000001e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 		 468 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  42.93 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  42.93 
 
 		 456 aa  330  2e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.24 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  47.73 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  46.46 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  43.35 
 
 		 435 aa  329  7e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  44 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.97 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  45.96 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  44.44 
 
 		 438 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  44.23 
 
 		 456 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  43.68 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.45 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.29 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  43.03 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  43.03 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  44.08 
 
 		 439 aa  318  9e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  49.12 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  44.39 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.95 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.95 
 
 		 482 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  44.19 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  39.96 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  44.19 
 
 		 444 aa  309  6.999999999999999e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  42.92 
 
 		 444 aa  308  9e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.55 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  43.01 
 
 		 445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  40.77 
 
 		 480 aa  305  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 		 471 aa  306  7e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  42.28 
 
 		 478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  41.81 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  38.92 
 
 		 479 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  42.64 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0713  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 		 459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.290846  normal  0.150395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 		 453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  41.13 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  44.58 
 
 		 445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  41.13 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  47.59 
 
 		 507 aa  303  4.0000000000000003e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  42.25 
 
 		 538 aa  302  6.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 479 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  41.33 
 
 		 481 aa  302  9e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  40.53 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  44.74 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  40.38 
 
 		 419 aa  299  5e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  48.02 
 
 		 446 aa  298  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  43.81 
 
 		 441 aa  298  9e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  49.08 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 		 479 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  42.02 
 
 		 550 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  43.54 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  47.34 
 
 		 498 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  49.09 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  49.09 
 
 		 440 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48.77 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  41.62 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  42.53 
 
 		 476 aa  296  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 447 aa  296  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  42.79 
 
 		 448 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  39.72 
 
 		 444 aa  295  8e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.13 
 
 		 440 aa  295  8e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.98 
 
 		 444 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  39.18 
 
 		 515 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  41.87 
 
 		 481 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  42.54 
 
 		 448 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.81 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>