More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1232 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  100 
 
 		 440 aa  896    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  59.19 
 
 		 448 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  59.19 
 
 		 448 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  60.37 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  58.26 
 
 		 449 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  56.42 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  59.5 
 
 		 423 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  56.09 
 
 		 441 aa  469  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  58.1 
 
 		 471 aa  470  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  58.16 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  59.21 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  59.35 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  58.52 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  58.89 
 
 		 445 aa  461  1e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  57.71 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  57.45 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  58.62 
 
 		 458 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  57.94 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  57.71 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  58.85 
 
 		 457 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  59.06 
 
 		 452 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  58.42 
 
 		 446 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  58.65 
 
 		 453 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  55.05 
 
 		 445 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  53.2 
 
 		 463 aa  438  9.999999999999999e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  55.21 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  55.21 
 
 		 424 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  55.66 
 
 		 447 aa  433  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  56.23 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  56.48 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  56.84 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  53.18 
 
 		 440 aa  423  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  54.31 
 
 		 444 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  55.09 
 
 		 444 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  56.96 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  52.86 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.74 
 
 		 438 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.49 
 
 		 439 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  51.12 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  52.88 
 
 		 438 aa  385  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  51.74 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  50.98 
 
 		 441 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  49.52 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  52.64 
 
 		 436 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.25 
 
 		 436 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  48.5 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.75 
 
 		 445 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.22 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.74 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  51 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.14 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  49 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.93 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  53.01 
 
 		 463 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  48.74 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 444 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  46.91 
 
 		 480 aa  362  9e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  47.77 
 
 		 452 aa  358  9e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  49.18 
 
 		 468 aa  356  5e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 		 476 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.96 
 
 		 455 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 439 aa  354  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 		 438 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  48.51 
 
 		 441 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.12 
 
 		 444 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  51.26 
 
 		 449 aa  348  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 481 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  48.52 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  48.52 
 
 		 445 aa  340  4e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.54 
 
 		 457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.33 
 
 		 450 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  49.71 
 
 		 482 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  53.03 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  49.71 
 
 		 482 aa  335  9e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  43.9 
 
 		 455 aa  332  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.47 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  49.57 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  44.19 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  40.7 
 
 		 435 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 437 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  43.72 
 
 		 444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  49.33 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  43.85 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.44 
 
 		 419 aa  320  5e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  43.99 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  48.07 
 
 		 477 aa  315  7e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 477 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  41.97 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 		 522 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>