More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0618 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
444 aa  885    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  98.2 
 
 
444 aa  872    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  96.85 
 
 
444 aa  861    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  67.57 
 
 
438 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  65.61 
 
 
437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  65.81 
 
 
435 aa  564  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  66.43 
 
 
434 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  65.79 
 
 
419 aa  549  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  59.35 
 
 
439 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  59.26 
 
 
439 aa  497  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  47.01 
 
 
445 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 
446 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  42.41 
 
 
432 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 
438 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 
438 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  44.67 
 
 
438 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  44.42 
 
 
437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.52 
 
 
445 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 
428 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.03 
 
 
441 aa  332  8e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  41.57 
 
 
448 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  40.96 
 
 
468 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 
448 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 
438 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  44.03 
 
 
462 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  43.92 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  40.99 
 
 
480 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  45.16 
 
 
439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.84 
 
 
461 aa  325  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 
449 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 
452 aa  325  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  42.93 
 
 
439 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  44.17 
 
 
436 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.68 
 
 
452 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 
436 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 
462 aa  321  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  47.85 
 
 
458 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  43.14 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  46.49 
 
 
445 aa  320  3e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  40.91 
 
 
476 aa  320  3e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.45 
 
 
423 aa  319  5e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  40.55 
 
 
468 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  41.12 
 
 
441 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  50 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  49.27 
 
 
451 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 
438 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
457 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  39.2 
 
 
440 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  48.84 
 
 
456 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  43.78 
 
 
444 aa  316  6e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  43.27 
 
 
443 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.97 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  42.82 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  40.95 
 
 
471 aa  313  4.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  46.34 
 
 
447 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 
445 aa  312  7.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.89 
 
 
443 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  45.17 
 
 
446 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  40.67 
 
 
455 aa  311  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  47.71 
 
 
453 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 
445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  45.92 
 
 
483 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  47.12 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  43.83 
 
 
440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  45.12 
 
 
440 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  44.25 
 
 
472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  44.85 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  42.89 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  44.85 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  38.55 
 
 
455 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  43.78 
 
 
480 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 
410 aa  302  8.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.74 
 
 
440 aa  302  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  39.11 
 
 
479 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.66 
 
 
426 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 
444 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 
443 aa  301  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 
423 aa  300  3e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 
422 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 
444 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.08 
 
 
440 aa  299  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  44.96 
 
 
463 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  40.73 
 
 
444 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  40.76 
 
 
445 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  40.76 
 
 
445 aa  296  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  42.19 
 
 
440 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  40.05 
 
 
479 aa  296  5e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  41.34 
 
 
428 aa  296  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  42.19 
 
 
440 aa  296  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.72 
 
 
429 aa  295  9e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  44.13 
 
 
433 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 
478 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.59 
 
 
439 aa  294  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  38.35 
 
 
478 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  42.39 
 
 
478 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  42.71 
 
 
444 aa  293  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
530 aa  293  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  40.05 
 
 
479 aa  293  5e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 
477 aa  292  7e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>