More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0030 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  100 
 
 		 439 aa  875    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  62.53 
 
 		 432 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  61.36 
 
 		 441 aa  532  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  59.85 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  60.86 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  56.36 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  53.85 
 
 		 476 aa  477  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  59.11 
 
 		 426 aa  476  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  59.85 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  56.44 
 
 		 481 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  58.12 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  58.12 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  54.87 
 
 		 462 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  58.04 
 
 		 468 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  57.54 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  57.29 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  56.78 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  53.81 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  58.38 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  58.38 
 
 		 436 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  57.25 
 
 		 445 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  53.64 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  52.31 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  51.41 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  52.5 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  52.5 
 
 		 445 aa  444  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  57.97 
 
 		 445 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  51.27 
 
 		 440 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  51.17 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  49.02 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  49.02 
 
 		 482 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  52.41 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  51.01 
 
 		 443 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  50.69 
 
 		 450 aa  409  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  52 
 
 		 455 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  53.63 
 
 		 438 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.97 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  47.08 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.15 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  53.16 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  50.23 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.16 
 
 		 444 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.33 
 
 		 461 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  51.77 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  51.65 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.94 
 
 		 457 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  47.1 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  47.1 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  46.32 
 
 		 478 aa  388  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  47.65 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  51.49 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  52.17 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  52.17 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  51.65 
 
 		 451 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.24 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  47.47 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  52.82 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  48.1 
 
 		 515 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  45.91 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  47.24 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  49.77 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  47.47 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  52.82 
 
 		 424 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  51.79 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 		 530 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  49.87 
 
 		 521 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 		 445 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 452 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  48.51 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  49.36 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  49.36 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  48.28 
 
 		 550 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  49.36 
 
 		 530 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  50.52 
 
 		 522 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  50.78 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  49.36 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  49.36 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.48 
 
 		 440 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.9 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  51.39 
 
 		 453 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  49.01 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  47.82 
 
 		 538 aa  375  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 444 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  48.18 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.9 
 
 		 440 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  46.9 
 
 		 448 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  47.72 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  48.61 
 
 		 498 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  47.78 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  47.78 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.72 
 
 		 444 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>