More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1781 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 439 aa  882    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  58.88 
 
 		 441 aa  494  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  56.36 
 
 		 439 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  59.65 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  59.7 
 
 		 439 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  59.55 
 
 		 436 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  59.3 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  59.9 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  59.36 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  57.14 
 
 		 446 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  59.36 
 
 		 438 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  59.36 
 
 		 437 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  59.01 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  57.54 
 
 		 445 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  55.97 
 
 		 432 aa  455  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  57.46 
 
 		 445 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  57.53 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  54.63 
 
 		 468 aa  442  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  53.2 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.42 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  52 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.17 
 
 		 426 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.93 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.93 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  52.1 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  52.1 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  51.91 
 
 		 481 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  49.65 
 
 		 443 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  51.88 
 
 		 452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  51.65 
 
 		 441 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  49.34 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  52.16 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  50.74 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  50.11 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  49.87 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.52 
 
 		 461 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  50.45 
 
 		 480 aa  390  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  51.38 
 
 		 444 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 		 444 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.38 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 455 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  50.62 
 
 		 450 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  50.6 
 
 		 424 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  53.89 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50.6 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  52.35 
 
 		 451 aa  375  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  50.37 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  45.21 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  51.41 
 
 		 456 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  50.9 
 
 		 457 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  50.25 
 
 		 444 aa  363  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  51.49 
 
 		 434 aa  363  3e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  47.4 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  52.65 
 
 		 458 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  49 
 
 		 447 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.69 
 
 		 440 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  51.66 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  49.39 
 
 		 453 aa  362  8e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  48.15 
 
 		 444 aa  361  1e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  46.98 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  49.39 
 
 		 448 aa  360  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  47.71 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  49.39 
 
 		 448 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  49.61 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  49.61 
 
 		 440 aa  359  6e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  47.52 
 
 		 530 aa  358  7e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  49.61 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  47.03 
 
 		 515 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  47.72 
 
 		 526 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  46.86 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  45.81 
 
 		 498 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  47.46 
 
 		 522 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  47.21 
 
 		 521 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  48.7 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  47.09 
 
 		 507 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  47.64 
 
 		 471 aa  355  6.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  48.47 
 
 		 444 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  48.45 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  46.99 
 
 		 440 aa  355  8.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  48.45 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  48.45 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.62 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  46.76 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  47.97 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 462 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  45.43 
 
 		 478 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  46.91 
 
 		 415 aa  352  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  47.7 
 
 		 458 aa  352  7e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  46.45 
 
 		 524 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.45 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.45 
 
 		 524 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  46.45 
 
 		 524 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  46.45 
 
 		 524 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.45 
 
 		 524 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  46.45 
 
 		 530 aa  352  8.999999999999999e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 		 478 aa  351  1e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 		 511 aa  352  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>