More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2562 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  85.91 
 
 		 440 aa  783    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  98.18 
 
 		 440 aa  871    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  87.24 
 
 		 446 aa  789    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 440 aa  880    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 440 aa  880    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  85.23 
 
 		 440 aa  780    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  69.48 
 
 		 456 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  69.02 
 
 		 458 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  70.16 
 
 		 457 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  69.84 
 
 		 447 aa  623  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  68.55 
 
 		 451 aa  618  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  68.59 
 
 		 445 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  67.73 
 
 		 452 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  72.26 
 
 		 423 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  69.93 
 
 		 451 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  65.92 
 
 		 453 aa  592  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  63.29 
 
 		 444 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  61.27 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  61.5 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  61.5 
 
 		 440 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  58.81 
 
 		 444 aa  522  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  61.74 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  61.31 
 
 		 444 aa  521  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  58.54 
 
 		 442 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  60.73 
 
 		 424 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  60.73 
 
 		 424 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  59.1 
 
 		 434 aa  494  9.999999999999999e-139  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  57.71 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  55.5 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  59.14 
 
 		 445 aa  431  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  55.34 
 
 		 449 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  53.02 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  53.02 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  52.18 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  50.23 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  51.29 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  54.65 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.9 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  50.27 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  52.53 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  49.24 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.88 
 
 		 438 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  48.64 
 
 		 441 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  47.07 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 		 481 aa  359  5e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  46.88 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  49.61 
 
 		 439 aa  359  6e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 438 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 444 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.19 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  54.57 
 
 		 480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  47.02 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 452 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  49.1 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 438 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.47 
 
 		 455 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  48.18 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.85 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.64 
 
 		 444 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.87 
 
 		 445 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.87 
 
 		 445 aa  350  2e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.76 
 
 		 437 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.39 
 
 		 444 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.89 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.73 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  51.25 
 
 		 449 aa  347  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  47.93 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.34 
 
 		 450 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  44.98 
 
 		 446 aa  345  8.999999999999999e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  47.95 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.85 
 
 		 436 aa  342  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  47.69 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  50.27 
 
 		 483 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  48.85 
 
 		 436 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.92 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.92 
 
 		 482 aa  338  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.92 
 
 		 482 aa  338  8e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  46.32 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 		 440 aa  332  6e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 		 446 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  48.33 
 
 		 455 aa  325  9e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.84 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  47.91 
 
 		 479 aa  325  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.93 
 
 		 415 aa  323  5e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  46.53 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  46.53 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  44.31 
 
 		 456 aa  319  5e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  48.12 
 
 		 479 aa  319  5e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  45.53 
 
 		 456 aa  319  6e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  47.1 
 
 		 478 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.04 
 
 		 457 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  46.42 
 
 		 478 aa  316  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  47.58 
 
 		 479 aa  315  7e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  46.59 
 
 		 422 aa  316  7e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  49.3 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>