More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3288 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
432 aa  867    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  66.59 
 
 
428 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  62.53 
 
 
439 aa  536  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  60.75 
 
 
441 aa  504  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  61.43 
 
 
426 aa  489  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  59.49 
 
 
462 aa  482  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  59.95 
 
 
468 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  54.03 
 
 
468 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  55.97 
 
 
439 aa  455  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  51.91 
 
 
476 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  58.81 
 
 
438 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  54.93 
 
 
483 aa  451  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  51.36 
 
 
446 aa  450  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.79 
 
 
480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  57.36 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  57.36 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  57.25 
 
 
438 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  56.82 
 
 
438 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  57.25 
 
 
438 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  55.13 
 
 
440 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  56.28 
 
 
445 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  55.45 
 
 
481 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  55.83 
 
 
437 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  55.36 
 
 
439 aa  432  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  55.83 
 
 
439 aa  434  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  53.94 
 
 
445 aa  431  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  51.71 
 
 
445 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  51.71 
 
 
445 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  50.62 
 
 
443 aa  412  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  55.56 
 
 
451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  52.13 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  56.74 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  56.27 
 
 
423 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.06 
 
 
452 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 
444 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.97 
 
 
450 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  47 
 
 
444 aa  396  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  54.62 
 
 
482 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  47.94 
 
 
441 aa  396  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  54.16 
 
 
415 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  53.57 
 
 
458 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  50.8 
 
 
457 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  50.34 
 
 
456 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  54.62 
 
 
482 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  48.76 
 
 
455 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 
441 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  46.54 
 
 
444 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.89 
 
 
438 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  51.12 
 
 
440 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  48.27 
 
 
471 aa  389  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 
440 aa  388  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  49.41 
 
 
440 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 
440 aa  388  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  53.06 
 
 
453 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  50.74 
 
 
445 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  52.2 
 
 
440 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 
538 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  47.91 
 
 
444 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  49.04 
 
 
515 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.77 
 
 
480 aa  382  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  50.8 
 
 
452 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 
550 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.1 
 
 
444 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  51.42 
 
 
446 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  43.1 
 
 
479 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  48.33 
 
 
530 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
515 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  43.71 
 
 
478 aa  378  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 
524 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  48.55 
 
 
549 aa  376  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  47.5 
 
 
524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  47.5 
 
 
524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  47.5 
 
 
524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  47.5 
 
 
530 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  46.26 
 
 
448 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  47.5 
 
 
524 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  45.23 
 
 
457 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  44.68 
 
 
521 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 
478 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  43.07 
 
 
478 aa  377  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  43.07 
 
 
478 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 
530 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 
448 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
513 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  49.51 
 
 
511 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
515 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 
477 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 
445 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  50.65 
 
 
440 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  50.26 
 
 
447 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  47.48 
 
 
532 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  47.22 
 
 
477 aa  370  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  48.21 
 
 
522 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 
481 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  44.83 
 
 
479 aa  370  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 
445 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  48.93 
 
 
440 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.37 
 
 
444 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>