More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2392 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  100 
 
 		 468 aa  936    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  66.81 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  63.38 
 
 		 481 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  59.75 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  61.66 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  54.03 
 
 		 432 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  52.4 
 
 		 441 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  51.4 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  51.41 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  51.33 
 
 		 478 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 		 515 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  49.9 
 
 		 515 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  51.33 
 
 		 478 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  54.63 
 
 		 439 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  51.6 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  51.53 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  51.33 
 
 		 478 aa  445  1e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 		 530 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  50.32 
 
 		 515 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  49.27 
 
 		 513 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 524 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  50 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  50 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  51.28 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  54.04 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  50 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  50 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  50.53 
 
 		 481 aa  440  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  49.79 
 
 		 521 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  49.89 
 
 		 511 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  50 
 
 		 524 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  51.41 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  51.63 
 
 		 538 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  51.64 
 
 		 549 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  55.06 
 
 		 532 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  54.75 
 
 		 535 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 452 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  50.11 
 
 		 522 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  50.34 
 
 		 426 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  52.63 
 
 		 436 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  52.57 
 
 		 443 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  53.36 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.4 
 
 		 436 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 428 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  49.78 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  50.79 
 
 		 526 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  53.61 
 
 		 439 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 446 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  51.73 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.72 
 
 		 439 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  52.2 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  51.86 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.76 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  48.5 
 
 		 455 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  52.3 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.76 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.76 
 
 		 438 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  50.93 
 
 		 443 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  48.07 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  51.5 
 
 		 445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.61 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.61 
 
 		 445 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.42 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  48.06 
 
 		 441 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  50.8 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  48.45 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  49.77 
 
 		 477 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.46 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  49.77 
 
 		 450 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.43 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  45.68 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.48 
 
 		 438 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.98 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.53 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  51.36 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.21 
 
 		 423 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  49.43 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  48.73 
 
 		 456 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  47.07 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  49.6 
 
 		 482 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  52.47 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  49.6 
 
 		 482 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  48.75 
 
 		 457 aa  362  9e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  48.01 
 
 		 440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.18 
 
 		 440 aa  356  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  47.9 
 
 		 424 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  51.25 
 
 		 453 aa  356  5.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  47.91 
 
 		 442 aa  355  7.999999999999999e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  45.51 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  47.9 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  50.52 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.76 
 
 		 445 aa  353  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  50.39 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  48.02 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>