More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0574 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 462 aa  930    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  63.68 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  61.47 
 
 		 449 aa  551  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 440 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  50.11 
 
 		 444 aa  391  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  49.77 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  54.9 
 
 		 451 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  47.41 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  51.43 
 
 		 442 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  53.7 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  48.82 
 
 		 451 aa  381  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  54.79 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.73 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  51.13 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  53.7 
 
 		 424 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  49.62 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  49.65 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  49.53 
 
 		 456 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  50.88 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  48.06 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  49.64 
 
 		 445 aa  373  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  54.21 
 
 		 457 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  48.62 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  48.93 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 		 463 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  53.45 
 
 		 453 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  48.94 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  48.05 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 448 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.47 
 
 		 439 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  47.1 
 
 		 445 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 432 aa  359  7e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  47.29 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  51.41 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  48.36 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  45.86 
 
 		 447 aa  350  3e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.52 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.52 
 
 		 445 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  47.59 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  48.97 
 
 		 446 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  52.12 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  45 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  47.97 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  47.97 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.31 
 
 		 468 aa  338  8e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  42.38 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  47.46 
 
 		 438 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  42.17 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 		 476 aa  333  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.45 
 
 		 443 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.65 
 
 		 455 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  46.7 
 
 		 437 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  46.29 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  46.46 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.42 
 
 		 426 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.31 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.64 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 		 438 aa  326  5e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 		 439 aa  326  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49 
 
 		 439 aa  326  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  45.94 
 
 		 445 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  43.47 
 
 		 472 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.59 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  42.58 
 
 		 437 aa  325  1e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  46.04 
 
 		 444 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  48.26 
 
 		 481 aa  323  3e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.33 
 
 		 443 aa  323  6e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  47.06 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 444 aa  322  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.86 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  48.86 
 
 		 436 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  44 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  48.26 
 
 		 445 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  41 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  40.77 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 		 422 aa  316  5e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.72 
 
 		 444 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.06 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.16 
 
 		 444 aa  315  7e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  42.04 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  48.11 
 
 		 483 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  45.68 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  44.81 
 
 		 530 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  45.68 
 
 		 526 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  45.98 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  46.22 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  46.22 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  46.22 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.22 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.22 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.22 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.92 
 
 		 521 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  46.22 
 
 		 524 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>