More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0477 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  87.23 
 
 
530 aa  897    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  68.18 
 
 
549 aa  690    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  88.45 
 
 
522 aa  874    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  99.62 
 
 
524 aa  1057    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  99.62 
 
 
524 aa  1057    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  99.62 
 
 
524 aa  1057    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  70.06 
 
 
532 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  93.24 
 
 
511 aa  903    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  100 
 
 
530 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  91.72 
 
 
515 aa  932    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
524 aa  1060    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
530 aa  967    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  92.61 
 
 
515 aa  901    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  98.56 
 
 
521 aa  960    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  85.71 
 
 
526 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  70.27 
 
 
535 aa  672    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  68.14 
 
 
550 aa  701    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  92.61 
 
 
515 aa  901    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  99.62 
 
 
524 aa  1057    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  92.61 
 
 
515 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  93.06 
 
 
513 aa  907    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  92.61 
 
 
515 aa  901    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  68.71 
 
 
538 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  65.97 
 
 
477 aa  632  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  64.72 
 
 
477 aa  608  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  57.5 
 
 
479 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  55.72 
 
 
480 aa  530  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  56.29 
 
 
479 aa  528  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  55.62 
 
 
481 aa  523  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  54.41 
 
 
478 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  54.79 
 
 
479 aa  513  1e-144  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  53.53 
 
 
478 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  53.11 
 
 
478 aa  498  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  53.11 
 
 
478 aa  498  1e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  51.01 
 
 
490 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  53.55 
 
 
482 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  51.24 
 
 
476 aa  458  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 
481 aa  450  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  48.43 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50 
 
 
468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  54.43 
 
 
483 aa  431  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  55.17 
 
 
426 aa  385  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.04 
 
 
439 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.5 
 
 
432 aa  379  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  45.77 
 
 
441 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  48.31 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  48.31 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  47.78 
 
 
438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.89 
 
 
437 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.66 
 
 
436 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  52.66 
 
 
436 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  43.74 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.04 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  52.52 
 
 
445 aa  356  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.25 
 
 
439 aa  356  5.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.54 
 
 
438 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  52.67 
 
 
445 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.71 
 
 
428 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.27 
 
 
439 aa  347  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  45.18 
 
 
444 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.81 
 
 
468 aa  343  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.08 
 
 
444 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.01 
 
 
482 aa  339  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.01 
 
 
482 aa  339  9e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.81 
 
 
462 aa  339  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  46.79 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  46.79 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  46.9 
 
 
443 aa  337  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  46.54 
 
 
443 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.89 
 
 
450 aa  333  5e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.37 
 
 
444 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.35 
 
 
441 aa  331  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.63 
 
 
440 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  44.12 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 
415 aa  327  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.41 
 
 
451 aa  326  5e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.35 
 
 
457 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 
461 aa  326  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.94 
 
 
423 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  49.73 
 
 
451 aa  323  4e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  47.81 
 
 
458 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 
471 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.54 
 
 
438 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  44.94 
 
 
452 aa  320  6e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  49.3 
 
 
456 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  47.63 
 
 
457 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  46.19 
 
 
444 aa  318  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 
452 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 
444 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.22 
 
 
444 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 
424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  39.36 
 
 
441 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  45.08 
 
 
445 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 
424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 
440 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  43.2 
 
 
443 aa  312  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
472 aa  311  1e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  46.23 
 
 
442 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  45.22 
 
 
444 aa  311  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.71 
 
 
440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>