More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3451 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  73.88 
 
 
424 aa  637    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  73.88 
 
 
424 aa  638    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  71.36 
 
 
440 aa  644    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  71.82 
 
 
440 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  70.81 
 
 
440 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
444 aa  887    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  70.23 
 
 
444 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  72.46 
 
 
442 aa  655    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  67.88 
 
 
434 aa  598  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  61.38 
 
 
440 aa  546  1e-154  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  63.16 
 
 
453 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  61.61 
 
 
440 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  59.78 
 
 
456 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  59.2 
 
 
458 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  60.79 
 
 
457 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  58.84 
 
 
451 aa  528  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  58.17 
 
 
452 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  59.86 
 
 
447 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  58.81 
 
 
440 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  58.81 
 
 
440 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  58.35 
 
 
440 aa  520  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  58.64 
 
 
446 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  61.39 
 
 
451 aa  518  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  61.72 
 
 
423 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  58.55 
 
 
445 aa  512  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  61.52 
 
 
444 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  60.32 
 
 
444 aa  503  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  53.53 
 
 
445 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  54.31 
 
 
440 aa  422  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  55.58 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  55.58 
 
 
448 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  50.69 
 
 
471 aa  417  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  54.72 
 
 
449 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  52.52 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  50.69 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  50.11 
 
 
462 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  49.77 
 
 
439 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 
461 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  49.53 
 
 
441 aa  382  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.44 
 
 
438 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  52.94 
 
 
438 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.44 
 
 
438 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  52.43 
 
 
437 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  51.03 
 
 
438 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  46.17 
 
 
457 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  51.28 
 
 
439 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  48.51 
 
 
463 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  48.03 
 
 
476 aa  364  2e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.75 
 
 
438 aa  363  3e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.43 
 
 
428 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.54 
 
 
452 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.98 
 
 
432 aa  361  1e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  50.9 
 
 
445 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.75 
 
 
443 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  51.14 
 
 
445 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  51.14 
 
 
445 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  50 
 
 
443 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  50.51 
 
 
436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  50.51 
 
 
436 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  51.42 
 
 
449 aa  355  7.999999999999999e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  45.37 
 
 
472 aa  354  2e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.23 
 
 
439 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 
444 aa  353  5e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  48.3 
 
 
444 aa  353  5e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.45 
 
 
468 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  49.75 
 
 
445 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  50.53 
 
 
480 aa  347  3e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  48.06 
 
 
426 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  47.37 
 
 
444 aa  346  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.02 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.81 
 
 
462 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  48.77 
 
 
450 aa  342  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.06 
 
 
446 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  48.52 
 
 
483 aa  341  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  45.77 
 
 
481 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  45.93 
 
 
482 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 
482 aa  340  4e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  45.57 
 
 
437 aa  338  1.9999999999999998e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.84 
 
 
441 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  46.3 
 
 
468 aa  332  9e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  43.68 
 
 
434 aa  329  7e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  45.58 
 
 
457 aa  329  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  47.22 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  46.79 
 
 
498 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  47.09 
 
 
458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  43.43 
 
 
440 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.57 
 
 
444 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.74 
 
 
435 aa  320  3e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  48.27 
 
 
530 aa  319  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  45.56 
 
 
515 aa  318  9e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  46.78 
 
 
515 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 
456 aa  317  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  48 
 
 
526 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  48 
 
 
522 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  48.27 
 
 
521 aa  316  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
515 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
515 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  45.91 
 
 
513 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 
515 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>