More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  76.59 
 
 
438 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  75.06 
 
 
445 aa  664    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  75.28 
 
 
445 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  74.55 
 
 
439 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  76.59 
 
 
438 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  83.63 
 
 
438 aa  673    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  100 
 
 
439 aa  875    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  76.08 
 
 
437 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  76.59 
 
 
438 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  79.85 
 
 
436 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  79.85 
 
 
436 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  57.57 
 
 
439 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  60.15 
 
 
468 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  53.29 
 
 
462 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  57.37 
 
 
440 aa  464  1e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  54.88 
 
 
441 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  55.5 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  56.22 
 
 
446 aa  443  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  52.43 
 
 
476 aa  442  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  55.83 
 
 
432 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  55.45 
 
 
428 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  56.68 
 
 
426 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  51.6 
 
 
445 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  51.6 
 
 
445 aa  423  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  52.19 
 
 
468 aa  422  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  52.85 
 
 
443 aa  419  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51 
 
 
480 aa  415  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  48.97 
 
 
443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  50.34 
 
 
457 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  55.91 
 
 
481 aa  403  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  47.99 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  50.34 
 
 
450 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  51.24 
 
 
441 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  52.56 
 
 
483 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  50.37 
 
 
444 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
455 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 
442 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.87 
 
 
438 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  55.65 
 
 
482 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  55.65 
 
 
482 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.52 
 
 
461 aa  391  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
424 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
424 aa  385  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  52.01 
 
 
415 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 
444 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.2 
 
 
440 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
428 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 
444 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  51.17 
 
 
498 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 
471 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  50.38 
 
 
451 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 
444 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  51.28 
 
 
444 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 
447 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  46.71 
 
 
444 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  46.99 
 
 
422 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 
451 aa  363  3e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 
440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 
458 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  48.46 
 
 
458 aa  362  6e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  47.76 
 
 
434 aa  362  6e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  46.87 
 
 
445 aa  362  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  47.91 
 
 
440 aa  361  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 
445 aa  361  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  47.15 
 
 
440 aa  361  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  47.15 
 
 
440 aa  361  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  50.64 
 
 
423 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  47.21 
 
 
440 aa  360  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.11 
 
 
444 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 
440 aa  359  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  48.98 
 
 
456 aa  358  7e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  45.87 
 
 
441 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  48.64 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  48.67 
 
 
456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  48.15 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  48.85 
 
 
457 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  47.1 
 
 
444 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  44.47 
 
 
456 aa  355  7.999999999999999e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  51.4 
 
 
507 aa  355  1e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  44.24 
 
 
456 aa  354  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.02 
 
 
452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  46.03 
 
 
446 aa  352  5e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  45.43 
 
 
480 aa  351  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  46.44 
 
 
445 aa  350  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  46.1 
 
 
515 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
477 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  44.37 
 
 
478 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  44.6 
 
 
478 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  47.23 
 
 
433 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  46.34 
 
 
440 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  43.76 
 
 
530 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  46.98 
 
 
449 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.87 
 
 
521 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  48.02 
 
 
515 aa  347  3e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  43.49 
 
 
479 aa  346  4e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  45.64 
 
 
530 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  46.12 
 
 
472 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  47.77 
 
 
515 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  45.64 
 
 
530 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  47.77 
 
 
515 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>