More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3158 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  75.46 
 
 		 428 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 433 aa  874    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  67.13 
 
 		 443 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  63.16 
 
 		 429 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  56.12 
 
 		 422 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  52.09 
 
 		 423 aa  435  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  50.37 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.06 
 
 		 452 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  46.36 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.24 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  48.86 
 
 		 438 aa  358  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.01 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.62 
 
 		 436 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.73 
 
 		 445 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.73 
 
 		 450 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  47.64 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  46.23 
 
 		 444 aa  348  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.15 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  47.72 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  47.72 
 
 		 438 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.36 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.91 
 
 		 441 aa  346  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.94 
 
 		 444 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  47.46 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.46 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  45.92 
 
 		 428 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  48.54 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  44.16 
 
 		 444 aa  342  8e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  44.09 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  44.09 
 
 		 445 aa  340  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  46.29 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  45 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  45.01 
 
 		 439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  52.44 
 
 		 445 aa  336  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  45.08 
 
 		 468 aa  335  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  47.92 
 
 		 439 aa  333  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  47.53 
 
 		 476 aa  333  4e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  44.58 
 
 		 468 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.53 
 
 		 480 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.25 
 
 		 462 aa  331  1e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  43.72 
 
 		 435 aa  331  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  45.16 
 
 		 444 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  43.53 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.97 
 
 		 461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.96 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  41.76 
 
 		 439 aa  322  8e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  45.52 
 
 		 481 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  43.53 
 
 		 458 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.01 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  44.69 
 
 		 453 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  43.65 
 
 		 456 aa  320  3e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  43.85 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.3 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 		 410 aa  319  7e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  42.62 
 
 		 456 aa  317  3e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  42.04 
 
 		 456 aa  316  4e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 		 440 aa  316  5e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  43.83 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  44.66 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  43.83 
 
 		 482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  45.05 
 
 		 440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 		 446 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 		 477 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  43.14 
 
 		 437 aa  313  3.9999999999999997e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  43.22 
 
 		 445 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  42.3 
 
 		 447 aa  312  9e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  42.72 
 
 		 444 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.51 
 
 		 426 aa  310  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  44.55 
 
 		 532 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  42.99 
 
 		 478 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.09 
 
 		 423 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  40.84 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  45.72 
 
 		 457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  42.14 
 
 		 438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  44.3 
 
 		 478 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  44.3 
 
 		 478 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 550 aa  305  7e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  42.92 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  43.27 
 
 		 477 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  41.23 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 		 535 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  44.07 
 
 		 549 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  45.29 
 
 		 444 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  43.04 
 
 		 479 aa  302  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  46.28 
 
 		 444 aa  301  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 		 456 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  46.11 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  43.26 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  45.33 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  43.93 
 
 		 515 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  41.11 
 
 		 444 aa  300  5e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  43.83 
 
 		 515 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  43.83 
 
 		 515 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>