More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2508 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 471 aa  954    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  68.69 
 
 		 445 aa  626  1e-178  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  66.74 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  66.74 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  66.89 
 
 		 449 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  67.42 
 
 		 445 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  64.64 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  58.1 
 
 		 440 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  53.03 
 
 		 446 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  54.11 
 
 		 440 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  56.31 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  54.3 
 
 		 444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  53.65 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  55.91 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  55.01 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  54.63 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  55.5 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  54.99 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  55.07 
 
 		 452 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  53.58 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  54.13 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  55.5 
 
 		 440 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  54.29 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  54.52 
 
 		 440 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  59.46 
 
 		 451 aa  436  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  51.74 
 
 		 453 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  53.01 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  51.24 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  52.21 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  53.94 
 
 		 444 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  50.69 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  52.06 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  50.34 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  52.91 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  58.94 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  48.7 
 
 		 463 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  48.65 
 
 		 439 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  48.27 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  51.07 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  53.67 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  50 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  50 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.41 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  47.73 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.1 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.4 
 
 		 445 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  47.82 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  49.76 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.33 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  47.1 
 
 		 437 aa  365  1e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  48.89 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 438 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  49.03 
 
 		 437 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  47.21 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  46.08 
 
 		 443 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  46.54 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.73 
 
 		 438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  47.64 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  44.33 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.28 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  48.03 
 
 		 436 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.47 
 
 		 455 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  42.77 
 
 		 468 aa  352  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.97 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  45.89 
 
 		 452 aa  349  6e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  45.3 
 
 		 426 aa  346  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.55 
 
 		 445 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.55 
 
 		 445 aa  345  8.999999999999999e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  42.89 
 
 		 435 aa  343  5e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  42.53 
 
 		 476 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  43.58 
 
 		 434 aa  340  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  43.96 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  46.47 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.32 
 
 		 450 aa  335  7e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 530 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 483 aa  333  5e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.01 
 
 		 441 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  43.86 
 
 		 515 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  44.9 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  44.87 
 
 		 481 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 		 444 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 		 522 aa  326  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  44.5 
 
 		 526 aa  325  9e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  47.49 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  47.49 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  47.49 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  47.49 
 
 		 515 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  45.37 
 
 		 521 aa  323  3e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  46.83 
 
 		 511 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  46.83 
 
 		 513 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.44 
 
 		 440 aa  323  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  43.27 
 
 		 444 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  44.62 
 
 		 439 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  44.88 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  44.88 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>