More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4733 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  86.34 
 
 		 446 aa  776    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  95.68 
 
 		 440 aa  856    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  73.73 
 
 		 447 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  71.56 
 
 		 456 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  71.1 
 
 		 458 aa  636    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  85.91 
 
 		 440 aa  783    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  71.99 
 
 		 445 aa  635    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  85 
 
 		 440 aa  781    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  85.91 
 
 		 440 aa  783    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 440 aa  883    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  71.33 
 
 		 457 aa  632  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  70.28 
 
 		 451 aa  616  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  69.44 
 
 		 452 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  73.89 
 
 		 423 aa  609  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  70.64 
 
 		 451 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  69.14 
 
 		 453 aa  602  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  64.64 
 
 		 444 aa  569  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  61.61 
 
 		 444 aa  544  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  63.15 
 
 		 440 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  63.15 
 
 		 440 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  60.98 
 
 		 444 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  63.85 
 
 		 440 aa  534  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  63.13 
 
 		 444 aa  529  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  61.74 
 
 		 424 aa  515  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  59.72 
 
 		 442 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  61.74 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  59.81 
 
 		 434 aa  503  1e-141  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  58.16 
 
 		 440 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  54.11 
 
 		 471 aa  451  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  53.41 
 
 		 441 aa  441  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  59.73 
 
 		 445 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  56.72 
 
 		 448 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  56.45 
 
 		 449 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  56.72 
 
 		 448 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  51.36 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  52.1 
 
 		 463 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  52.2 
 
 		 432 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  50.13 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  51.64 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.48 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  53.33 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  48.79 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  47.93 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  50.82 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  48.89 
 
 		 444 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  48 
 
 		 437 aa  363  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.47 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  47.69 
 
 		 439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.22 
 
 		 443 aa  361  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  47.18 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 		 452 aa  360  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.66 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  46.31 
 
 		 462 aa  356  3.9999999999999996e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50.9 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.61 
 
 		 441 aa  356  5e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  50.64 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  46.84 
 
 		 444 aa  353  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.82 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  48.02 
 
 		 468 aa  352  5e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 449 aa  350  2e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  46.6 
 
 		 444 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  49.22 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 		 468 aa  351  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 476 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  48.38 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 446 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  49.87 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  49.87 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  48.97 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.23 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  47.95 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  47.83 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.59 
 
 		 450 aa  342  8e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 		 483 aa  342  9e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 		 438 aa  342  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  48.21 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.65 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.65 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  50.15 
 
 		 445 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  45.69 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  46.75 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  48.23 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  47.57 
 
 		 479 aa  322  7e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  46.58 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  47.66 
 
 		 455 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  48.26 
 
 		 478 aa  321  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  45.63 
 
 		 530 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  46.94 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  46.94 
 
 		 478 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  50.62 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.02 
 
 		 457 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  46.27 
 
 		 478 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  48.8 
 
 		 481 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  48.53 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  41.97 
 
 		 439 aa  315  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  48 
 
 		 479 aa  313  4.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  44.26 
 
 		 532 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>