More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2591 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  92.43 
 
 		 449 aa  810    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  76.8 
 
 		 445 aa  672    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  99.78 
 
 		 448 aa  894    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  74.55 
 
 		 445 aa  667    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 448 aa  895    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  69.59 
 
 		 441 aa  626  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  66.74 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  59.19 
 
 		 440 aa  488  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  56.51 
 
 		 423 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  53.59 
 
 		 451 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  56.49 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  53.83 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  55.37 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  56.72 
 
 		 440 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  54.79 
 
 		 444 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  52.89 
 
 		 446 aa  429  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  54.61 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  52.8 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  53.02 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  52.85 
 
 		 452 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  52.51 
 
 		 456 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  53.02 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  53.76 
 
 		 458 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  52.35 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  55.58 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  51.97 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  52.33 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  61.61 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  53.09 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  53.33 
 
 		 440 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  52.06 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  51.01 
 
 		 463 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  61.61 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  50.92 
 
 		 444 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  53.43 
 
 		 442 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  52.39 
 
 		 444 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 		 441 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  46.26 
 
 		 432 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.9 
 
 		 461 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  46.9 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.86 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  48.3 
 
 		 437 aa  367  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.4 
 
 		 445 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  49.5 
 
 		 463 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  47.95 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.63 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  49.63 
 
 		 438 aa  360  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  49.39 
 
 		 439 aa  360  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  48.79 
 
 		 462 aa  359  6e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  47.8 
 
 		 468 aa  359  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.72 
 
 		 443 aa  358  9e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 436 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.88 
 
 		 436 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  47.68 
 
 		 445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  48.15 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  48.61 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  47.41 
 
 		 428 aa  352  8.999999999999999e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  47.4 
 
 		 449 aa  351  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.67 
 
 		 441 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.21 
 
 		 455 aa  350  4e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  46.02 
 
 		 443 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  43.98 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  43.98 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  45.91 
 
 		 452 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 		 444 aa  339  8e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.8 
 
 		 434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.9 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  43.26 
 
 		 438 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.65 
 
 		 480 aa  337  3.9999999999999995e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  40.84 
 
 		 439 aa  336  5.999999999999999e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  44.2 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.99 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 		 444 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  42.09 
 
 		 439 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  47.24 
 
 		 450 aa  328  8e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  40.9 
 
 		 444 aa  327  3e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  43.1 
 
 		 483 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  41.12 
 
 		 444 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.66 
 
 		 446 aa  325  1e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.02 
 
 		 426 aa  325  1e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.06 
 
 		 476 aa  323  3e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  41.47 
 
 		 468 aa  319  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 		 481 aa  319  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 		 498 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 422 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  42.78 
 
 		 437 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  43.57 
 
 		 507 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  46.22 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  46.22 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  41.92 
 
 		 440 aa  309  6.999999999999999e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 		 446 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  43.61 
 
 		 457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  41.84 
 
 		 458 aa  306  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  42.86 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 		 455 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>