More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0725 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 428 aa  864    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.13 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.36 
 
 		 436 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.26 
 
 		 438 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  48.87 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  48.87 
 
 		 438 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.74 
 
 		 445 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  48.61 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  48.46 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  45.58 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 437 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.62 
 
 		 441 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  43.3 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  44.36 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  47.92 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 		 432 aa  333  5e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  43.41 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  40.76 
 
 		 476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  44.81 
 
 		 439 aa  323  5e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.47 
 
 		 426 aa  322  5e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  42.44 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  41.96 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  41.96 
 
 		 445 aa  319  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  41.59 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  41.24 
 
 		 468 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  43.56 
 
 		 483 aa  313  4.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  44.75 
 
 		 438 aa  312  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  44.95 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  40.41 
 
 		 456 aa  310  4e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  41.84 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  40.18 
 
 		 456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  45.2 
 
 		 507 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  42.35 
 
 		 441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  44.89 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  43 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 422 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  44.04 
 
 		 415 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  41.92 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  43.59 
 
 		 444 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  41.07 
 
 		 478 aa  302  9e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  41.07 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 478 aa  301  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  43.26 
 
 		 433 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  43.15 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  41.29 
 
 		 444 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  41.73 
 
 		 443 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  45.11 
 
 		 498 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 		 479 aa  299  7e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  40.61 
 
 		 479 aa  298  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  39.4 
 
 		 443 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  42.16 
 
 		 444 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  43.93 
 
 		 445 aa  295  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  40.37 
 
 		 479 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.9 
 
 		 444 aa  293  4e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  38.98 
 
 		 481 aa  293  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  43.4 
 
 		 442 aa  292  8e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  40.39 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  40.04 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.5 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.23 
 
 		 480 aa  289  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  42.01 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  43.37 
 
 		 447 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  42.96 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  42.01 
 
 		 424 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  41.3 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  43.8 
 
 		 446 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.56 
 
 		 440 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 		 444 aa  285  7e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.94 
 
 		 440 aa  285  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.49 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 477 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  44.47 
 
 		 484 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  41.41 
 
 		 451 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  43.54 
 
 		 440 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  43.05 
 
 		 451 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 		 439 aa  281  1e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  40.68 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  40.25 
 
 		 429 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  44.12 
 
 		 410 aa  281  2e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  39.27 
 
 		 482 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  43.29 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  43.29 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  43.88 
 
 		 440 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  40.41 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  40.76 
 
 		 530 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  41.31 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  39.85 
 
 		 445 aa  277  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  41.9 
 
 		 458 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 457 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 550 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.65 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  40.47 
 
 		 526 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>