More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0208 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  71.67 
 
 		 515 aa  703    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  71.58 
 
 		 524 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  92.94 
 
 		 549 aa  959    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  71.64 
 
 		 511 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  98.33 
 
 		 550 aa  1068    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  71.58 
 
 		 524 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  84.2 
 
 		 532 aa  786    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  71.58 
 
 		 524 aa  710    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  71.58 
 
 		 530 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  69.12 
 
 		 515 aa  721    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  69.88 
 
 		 530 aa  720    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  71.16 
 
 		 521 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  72.08 
 
 		 515 aa  707    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  70.23 
 
 		 526 aa  696    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  71.58 
 
 		 524 aa  710    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  83.33 
 
 		 535 aa  788    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  72.08 
 
 		 515 aa  707    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  70.21 
 
 		 477 aa  666    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  71.58 
 
 		 530 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  67.62 
 
 		 522 aa  702    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 538 aa  1085    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  71.46 
 
 		 513 aa  701    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  72.08 
 
 		 515 aa  707    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  69.17 
 
 		 477 aa  679    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  71.58 
 
 		 524 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  59.71 
 
 		 479 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  58.87 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  57.71 
 
 		 478 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  57.8 
 
 		 480 aa  533  1e-150  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  56.88 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  55.83 
 
 		 478 aa  521  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  57.44 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  56.88 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  56.88 
 
 		 478 aa  520  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  53.04 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  54.6 
 
 		 482 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  52.01 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  49.28 
 
 		 481 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  49.06 
 
 		 480 aa  445  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  51.63 
 
 		 468 aa  439  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  54.79 
 
 		 483 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  49.16 
 
 		 432 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.71 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.65 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  53.2 
 
 		 426 aa  363  5.0000000000000005e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  48.2 
 
 		 428 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  46.15 
 
 		 438 aa  347  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  46.37 
 
 		 439 aa  345  8e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 436 aa  346  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  45.15 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  52.84 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  45.7 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  44.55 
 
 		 438 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  50 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  50.27 
 
 		 468 aa  342  8e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.99 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  44.77 
 
 		 445 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.24 
 
 		 462 aa  339  9e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  43.46 
 
 		 446 aa  334  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.94 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.94 
 
 		 445 aa  330  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  47.58 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 		 455 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.04 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  43.86 
 
 		 444 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 		 444 aa  326  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  45.24 
 
 		 443 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  41.42 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  46.29 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  42.26 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  47.85 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  43.68 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  45.93 
 
 		 452 aa  317  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  44.97 
 
 		 456 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  42.2 
 
 		 441 aa  316  8e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.4 
 
 		 423 aa  315  9.999999999999999e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.74 
 
 		 444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 457 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  45.29 
 
 		 451 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  48.75 
 
 		 440 aa  313  6.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  46.05 
 
 		 443 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.42 
 
 		 441 aa  312  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  40.86 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  48.42 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.91 
 
 		 457 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  44.92 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  46.38 
 
 		 444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 		 433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 		 445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  42.17 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  42.93 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.27 
 
 		 440 aa  306  7e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 		 447 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  45.21 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  46.49 
 
 		 455 aa  301  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  48.55 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 440 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>