More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1308 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  73.62 
 
 		 478 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  73.47 
 
 		 479 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  74.13 
 
 		 481 aa  734    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  69.04 
 
 		 480 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  74.08 
 
 		 479 aa  728    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  73.82 
 
 		 478 aa  733    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  74.64 
 
 		 478 aa  751    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 490 aa  998    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  75.51 
 
 		 479 aa  744    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  74.44 
 
 		 478 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  62.77 
 
 		 482 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  52.24 
 
 		 515 aa  481  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  51.42 
 
 		 530 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  51.6 
 
 		 550 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  51.86 
 
 		 481 aa  472  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  51.4 
 
 		 538 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  50.2 
 
 		 522 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  51.21 
 
 		 521 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  51.22 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  52.21 
 
 		 535 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  51.22 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  51.75 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  51.42 
 
 		 515 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  51.43 
 
 		 513 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  51.22 
 
 		 515 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  51.01 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  51.21 
 
 		 549 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  51.01 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  51.27 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  51.01 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  51.01 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  51.01 
 
 		 530 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  50 
 
 		 526 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  51.01 
 
 		 524 aa  465  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  51.01 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  51.41 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  50.31 
 
 		 476 aa  445  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  49.18 
 
 		 477 aa  441  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  49.79 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  47.66 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  49.78 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  45.29 
 
 		 439 aa  365  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.91 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.2 
 
 		 426 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  42.7 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  44.77 
 
 		 436 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  44.54 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.12 
 
 		 450 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  48.08 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  48.34 
 
 		 457 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  43.75 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.63 
 
 		 438 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  46.83 
 
 		 456 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  44.61 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  44.61 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  47.68 
 
 		 451 aa  329  6e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  43.92 
 
 		 438 aa  329  6e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  42.76 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.83 
 
 		 451 aa  326  6e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  42.74 
 
 		 439 aa  325  2e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.18 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.53 
 
 		 443 aa  322  8e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.65 
 
 		 444 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  42.63 
 
 		 445 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  43.05 
 
 		 455 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  45.19 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  42.37 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  45.19 
 
 		 482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  40.08 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 444 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 		 452 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.9 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  42.64 
 
 		 462 aa  315  9e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  40.2 
 
 		 456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  40 
 
 		 456 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  45.4 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.28 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.02 
 
 		 457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  39.78 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  41.95 
 
 		 445 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  45.45 
 
 		 453 aa  303  7.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.31 
 
 		 444 aa  302  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  38.84 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  41.46 
 
 		 447 aa  300  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  44.42 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  43.19 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  39.54 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  44.07 
 
 		 445 aa  297  3e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.83 
 
 		 507 aa  296  6e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  44.04 
 
 		 498 aa  292  9e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  45.1 
 
 		 444 aa  292  9e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  43.1 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  43.1 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>