More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_2252 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  100 
 
 		 484 aa  962    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  99.59 
 
 		 484 aa  959    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  72.06 
 
 		 507 aa  608  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  72.82 
 
 		 498 aa  568  1e-161  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  51.72 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  51.72 
 
 		 436 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.19 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  53.65 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  51.97 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  45.99 
 
 		 445 aa  361  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  52.1 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  52.1 
 
 		 438 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  48.53 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  50 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50.84 
 
 		 437 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  53.19 
 
 		 438 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  48.78 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50.14 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  51.15 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  51.22 
 
 		 439 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  47.98 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  47.98 
 
 		 482 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  46.79 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  47.26 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  47.26 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  43.99 
 
 		 462 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  49.85 
 
 		 428 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  49.41 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.01 
 
 		 481 aa  320  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 		 483 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.56 
 
 		 440 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  44.91 
 
 		 476 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  45.92 
 
 		 456 aa  317  2e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  45.62 
 
 		 456 aa  316  5e-85  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  47.58 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  47.58 
 
 		 478 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  46.77 
 
 		 424 aa  313  4.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.44 
 
 		 443 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  46.24 
 
 		 442 aa  309  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 		 478 aa  309  6.999999999999999e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.47 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  45.43 
 
 		 479 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  47.83 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  44.83 
 
 		 444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  45.6 
 
 		 480 aa  308  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  46.67 
 
 		 458 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  45.72 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  46.24 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  47.54 
 
 		 515 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 		 438 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  48.41 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  47.25 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  47.25 
 
 		 521 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 		 524 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 		 524 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 		 524 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  46.96 
 
 		 524 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  46.96 
 
 		 530 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  46.96 
 
 		 524 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  46.96 
 
 		 530 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  44.97 
 
 		 522 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.83 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  44.97 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  45.32 
 
 		 471 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  48.49 
 
 		 456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 		 513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  47.25 
 
 		 511 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  47.2 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  47.11 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  43.15 
 
 		 443 aa  302  8.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  45.02 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  42.03 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  46.05 
 
 		 457 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  43.64 
 
 		 440 aa  300  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  43.13 
 
 		 444 aa  299  7e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  40.91 
 
 		 451 aa  299  9e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  45.28 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  43.85 
 
 		 458 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 		 440 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  43.58 
 
 		 452 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  43.55 
 
 		 481 aa  296  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  44.11 
 
 		 447 aa  295  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  43.55 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  42.62 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.48 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  43.5 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  44.8 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  44.8 
 
 		 448 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  40.49 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.33 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  45.61 
 
 		 538 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>