More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2101 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  67.08 
 
 		 479 aa  656    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  67.7 
 
 		 478 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  66.67 
 
 		 478 aa  653    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  68.72 
 
 		 481 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  66.46 
 
 		 478 aa  652    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  71.37 
 
 		 480 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 482 aa  976    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  68.32 
 
 		 479 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  68.06 
 
 		 478 aa  662    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  66.94 
 
 		 479 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1308  carboxyl-terminal protease  63.8 
 
 		 490 aa  626  1e-178  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  53.2 
 
 		 515 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  51.62 
 
 		 530 aa  488  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  53.21 
 
 		 538 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  52.8 
 
 		 521 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  52.8 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  52.8 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  52.8 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  52.8 
 
 		 530 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  52.8 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  52.8 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  52.8 
 
 		 524 aa  478  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  51.51 
 
 		 522 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  50.73 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  52.59 
 
 		 550 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  51.96 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  51.96 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  52.16 
 
 		 515 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  51.96 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  51.31 
 
 		 526 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  51.97 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  51.65 
 
 		 513 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  51.22 
 
 		 549 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  50.32 
 
 		 481 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  51.23 
 
 		 532 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  51.65 
 
 		 535 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  49.38 
 
 		 477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  49.17 
 
 		 477 aa  448  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  49.47 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  50.96 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  47.99 
 
 		 468 aa  414  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  45.43 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 		 432 aa  363  3e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  42.6 
 
 		 428 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.39 
 
 		 441 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  45.75 
 
 		 438 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  46.45 
 
 		 436 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  46.68 
 
 		 436 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  45.48 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  45.71 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  43.22 
 
 		 444 aa  331  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  44.29 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.15 
 
 		 426 aa  330  5.0000000000000004e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  44.83 
 
 		 443 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  42.55 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  42.55 
 
 		 445 aa  329  6e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  43.78 
 
 		 438 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  44.01 
 
 		 438 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  45.64 
 
 		 450 aa  326  5e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  44.09 
 
 		 445 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  44.59 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  43.25 
 
 		 437 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  42.57 
 
 		 444 aa  322  7e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 440 aa  322  9.000000000000001e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  46.04 
 
 		 458 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  44.19 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  44.71 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  42.6 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  42.96 
 
 		 439 aa  315  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 457 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  45.48 
 
 		 456 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  47.62 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  46.5 
 
 		 423 aa  313  5.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  39.38 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  39.18 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  42.3 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  40.72 
 
 		 452 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  38.31 
 
 		 462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  45.74 
 
 		 452 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.67 
 
 		 441 aa  305  9.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  41.47 
 
 		 444 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.95 
 
 		 440 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  46.23 
 
 		 507 aa  301  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  44.32 
 
 		 415 aa  300  4e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 		 446 aa  300  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  43.94 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 		 446 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  45.69 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  46.74 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  46.74 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 		 440 aa  296  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 461 aa  295  9e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  41.71 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  47.67 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  41.08 
 
 		 433 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  42.13 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  42.43 
 
 		 444 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  46.2 
 
 		 440 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>