More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2868 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 423 aa  862    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  54.82 
 
 		 422 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  54.27 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  52.09 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  52.09 
 
 		 433 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  51.7 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  47.26 
 
 		 438 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  46.75 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.34 
 
 		 452 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  43.28 
 
 		 455 aa  340  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  47.27 
 
 		 440 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  46.95 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 		 436 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  47.29 
 
 		 445 aa  338  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  49.01 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  46.84 
 
 		 443 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  43.84 
 
 		 444 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  43.25 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  46.95 
 
 		 441 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  46.29 
 
 		 438 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  45.27 
 
 		 428 aa  332  8e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 438 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  45.85 
 
 		 439 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.67 
 
 		 457 aa  331  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  47.42 
 
 		 438 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  44.53 
 
 		 462 aa  329  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  45.11 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  45.84 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  44.36 
 
 		 444 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  45.71 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  44.88 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  48.69 
 
 		 445 aa  325  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  43.53 
 
 		 444 aa  325  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  42.64 
 
 		 439 aa  325  8.000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  47.17 
 
 		 476 aa  323  4e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  46.52 
 
 		 455 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  42.09 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  42.09 
 
 		 445 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  43.16 
 
 		 439 aa  318  1e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  43.03 
 
 		 410 aa  318  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  39.48 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.23 
 
 		 439 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  43.61 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 		 457 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  44.71 
 
 		 456 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  39.76 
 
 		 437 aa  310  4e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  42.48 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  47.43 
 
 		 440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  42.72 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  43.21 
 
 		 451 aa  306  3e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  40.72 
 
 		 419 aa  306  3e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.78 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.39 
 
 		 481 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  43.95 
 
 		 471 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  44.13 
 
 		 435 aa  306  6e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  42.58 
 
 		 445 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  41.52 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  42.26 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.62 
 
 		 423 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 446 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  42.34 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  40.83 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  44.22 
 
 		 444 aa  299  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  44.77 
 
 		 415 aa  298  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  42.12 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  45.75 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  45.82 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  41.67 
 
 		 444 aa  298  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  42.08 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  42.08 
 
 		 444 aa  297  2e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  45.3 
 
 		 441 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.24 
 
 		 480 aa  296  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 		 453 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  41.55 
 
 		 445 aa  296  6e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  43.77 
 
 		 437 aa  296  7e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  44.86 
 
 		 424 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  45.26 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  45.26 
 
 		 440 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  44.27 
 
 		 507 aa  294  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  44.86 
 
 		 424 aa  293  3e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  41.75 
 
 		 447 aa  293  5e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  45.01 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.63 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 		 440 aa  293  6e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 462 aa  292  7e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  43.62 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  42.96 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  42.96 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  42.96 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  42.96 
 
 		 530 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  42.96 
 
 		 530 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  41.78 
 
 		 442 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  44.44 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  42.96 
 
 		 524 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  42.96 
 
 		 524 aa  292  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  43.08 
 
 		 521 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>