More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0021 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 563 aa  1128    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  52.75 
 
 		 556 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  49.05 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  49.91 
 
 		 585 aa  483  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  48.79 
 
 		 564 aa  472  1e-132  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  45.68 
 
 		 572 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  40.6 
 
 		 582 aa  405  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 		 553 aa  356  7.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  34.97 
 
 		 550 aa  317  3e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 555 aa  307  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 		 557 aa  303  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  33.58 
 
 		 550 aa  295  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 566 aa  292  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  34.87 
 
 		 569 aa  289  8e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  33.64 
 
 		 545 aa  277  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  33.75 
 
 		 540 aa  273  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  36.03 
 
 		 452 aa  236  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  39.13 
 
 		 444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  38.25 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  36.19 
 
 		 445 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 		 453 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.32 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.36 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.22 
 
 		 432 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 		 471 aa  234  4.0000000000000004e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  35.85 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  35.77 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.91 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.49 
 
 		 440 aa  230  5e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  33.2 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  36.8 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 		 428 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 		 446 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.78 
 
 		 440 aa  226  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  34.28 
 
 		 457 aa  226  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 415 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 		 477 aa  224  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.56 
 
 		 444 aa  224  4e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  35.62 
 
 		 530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 		 530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  35.62 
 
 		 524 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  35.62 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  35.62 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  35.62 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 515 aa  223  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  35.62 
 
 		 524 aa  223  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 438 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 448 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.25 
 
 		 448 aa  223  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  35.37 
 
 		 521 aa  223  8e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.89 
 
 		 439 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  34.46 
 
 		 444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 478 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  37.87 
 
 		 513 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  36.98 
 
 		 522 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  34.69 
 
 		 479 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  36.98 
 
 		 526 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 456 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  31.44 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 457 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 441 aa  220  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 		 458 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.75 
 
 		 424 aa  220  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.09 
 
 		 443 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  34.15 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.98 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  34.43 
 
 		 449 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.8 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 455 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 		 446 aa  218  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.28 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  34.13 
 
 		 556 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.2 
 
 		 479 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.53 
 
 		 423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  38.92 
 
 		 463 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  36.53 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  36.53 
 
 		 451 aa  217  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  33.33 
 
 		 528 aa  217  5.9999999999999996e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  34.26 
 
 		 410 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  35.15 
 
 		 532 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 478 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.61 
 
 		 440 aa  216  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  37.5 
 
 		 479 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  34.78 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>