More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2514 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 506 aa  1037    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  40.79 
 
 		 439 aa  256  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.41 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  42.15 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 446 aa  252  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  42.02 
 
 		 440 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  38.68 
 
 		 451 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  39.66 
 
 		 429 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.1 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  39.1 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  38.56 
 
 		 457 aa  246  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.9 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  39.66 
 
 		 451 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.12 
 
 		 423 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  39.42 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  38.61 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 440 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  40.69 
 
 		 440 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 424 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  39.36 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 		 446 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  36.06 
 
 		 442 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 		 441 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  41.51 
 
 		 444 aa  241  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  39.04 
 
 		 438 aa  240  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.92 
 
 		 458 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 379 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  38.75 
 
 		 423 aa  239  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  39.9 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  39.9 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.36 
 
 		 443 aa  236  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 		 498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  34.67 
 
 		 434 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  36.36 
 
 		 435 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 		 452 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  41.07 
 
 		 441 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  36.14 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  34.81 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  41.64 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  38.27 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.18 
 
 		 439 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 418 aa  234  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.48 
 
 		 445 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.48 
 
 		 445 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  41.07 
 
 		 457 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  36.06 
 
 		 441 aa  234  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.83 
 
 		 456 aa  233  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.98 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  39.65 
 
 		 444 aa  233  8.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.08 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  38.69 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 		 438 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.09 
 
 		 507 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 444 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.96 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  39.14 
 
 		 476 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  34.99 
 
 		 444 aa  231  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 		 422 aa  230  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.59 
 
 		 443 aa  230  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  37.6 
 
 		 439 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  35.56 
 
 		 438 aa  229  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  36.59 
 
 		 553 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  36.55 
 
 		 453 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.64 
 
 		 445 aa  227  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.64 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.64 
 
 		 444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  39.4 
 
 		 426 aa  227  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 		 440 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 438 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  38.19 
 
 		 538 aa  225  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 438 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  38.4 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  35.52 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  35.52 
 
 		 448 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.82 
 
 		 482 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.82 
 
 		 482 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 461 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.81 
 
 		 450 aa  221  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 427 aa  221  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.43 
 
 		 444 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 484 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  38.24 
 
 		 530 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  38.11 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  38.11 
 
 		 526 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.81 
 
 		 439 aa  219  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>