More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0124 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 553 aa  1096    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  40.51 
 
 		 555 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  37.52 
 
 		 557 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  37 
 
 		 550 aa  365  1e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  36.78 
 
 		 550 aa  363  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  38.72 
 
 		 563 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 		 565 aa  350  3e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  39.15 
 
 		 564 aa  350  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 566 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  38.15 
 
 		 556 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  37.46 
 
 		 572 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 569 aa  320  5e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 585 aa  312  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  33.03 
 
 		 545 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  35.63 
 
 		 582 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  35.79 
 
 		 538 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  33.64 
 
 		 540 aa  303  8.000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  42.47 
 
 		 439 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  43.57 
 
 		 441 aa  262  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  38.27 
 
 		 842 aa  262  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 522 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  39.58 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  42.14 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 515 aa  259  8e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 535 aa  259  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 483 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  41.8 
 
 		 439 aa  258  3e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  39.58 
 
 		 530 aa  257  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 515 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 		 444 aa  256  6e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  42.54 
 
 		 428 aa  256  7e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  39.88 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 511 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  38.99 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  38.97 
 
 		 478 aa  254  3e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  42.72 
 
 		 440 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 478 aa  254  4.0000000000000004e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  44.89 
 
 		 426 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  38.99 
 
 		 524 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  38.99 
 
 		 524 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.99 
 
 		 524 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  38.99 
 
 		 524 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.99 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  39.29 
 
 		 476 aa  253  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 524 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.99 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  41.43 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  44.48 
 
 		 456 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.85 
 
 		 450 aa  250  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  40.36 
 
 		 480 aa  250  4e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  40.53 
 
 		 481 aa  250  4e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  34.52 
 
 		 471 aa  249  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  40.94 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 477 aa  249  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 		 440 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 538 aa  248  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  41.73 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  40.66 
 
 		 479 aa  248  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  41.13 
 
 		 443 aa  247  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  35.47 
 
 		 480 aa  247  4e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 410 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 		 440 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  42.95 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  42.95 
 
 		 445 aa  246  8e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  38.17 
 
 		 549 aa  246  9e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 		 479 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 455 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  41.25 
 
 		 479 aa  245  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  37.57 
 
 		 550 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  41.19 
 
 		 445 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  40.87 
 
 		 443 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  40.68 
 
 		 445 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3506  C-terminal processing peptidase-3  41.27 
 
 		 478 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.30805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  41.27 
 
 		 478 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  41.93 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  41.86 
 
 		 444 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  41.93 
 
 		 436 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.17 
 
 		 468 aa  243  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  40.68 
 
 		 445 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.12 
 
 		 439 aa  243  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  41.8 
 
 		 438 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  41.8 
 
 		 438 aa  243  9e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.98 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.11 
 
 		 446 aa  242  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.22 
 
 		 444 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.44 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  41.54 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  38.96 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  41.49 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  41.82 
 
 		 463 aa  241  2e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>