More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3963 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
383 aa  764    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  58.18 
 
 
383 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  51.62 
 
 
377 aa  391  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0474  carboxyl-terminal protease  56.94 
 
 
392 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  49.23 
 
 
395 aa  335  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0247  C-terminal processing peptidase-3  43.52 
 
 
387 aa  305  7e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  41.76 
 
 
379 aa  285  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  40.81 
 
 
389 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 
418 aa  258  9e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 
476 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  44.31 
 
 
445 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  43.16 
 
 
437 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  43.15 
 
 
445 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 
438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  43.33 
 
 
438 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  41.83 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  40.69 
 
 
443 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  39.73 
 
 
441 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.35 
 
 
440 aa  252  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  43.03 
 
 
438 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.2 
 
 
438 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  43.07 
 
 
439 aa  251  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  42.28 
 
 
468 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  38.23 
 
 
429 aa  246  3e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.84 
 
 
450 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  40.66 
 
 
458 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.59 
 
 
446 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  40.11 
 
 
398 aa  246  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  42.81 
 
 
456 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  41.21 
 
 
439 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  42.07 
 
 
444 aa  246  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  43.15 
 
 
436 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  43.15 
 
 
436 aa  246  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  40.27 
 
 
444 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  41.5 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  42.51 
 
 
457 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  39.23 
 
 
438 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  44.21 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.62 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  42.09 
 
 
446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  44.21 
 
 
482 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  43.15 
 
 
440 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  42.82 
 
 
423 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  37.84 
 
 
397 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.08 
 
 
426 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  42.81 
 
 
452 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  39.24 
 
 
461 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
441 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  42.64 
 
 
451 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
452 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  42.82 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  41.74 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  40.11 
 
 
444 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  40.85 
 
 
444 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  39.39 
 
 
444 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  41.37 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  41.37 
 
 
440 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  36.99 
 
 
455 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  41.01 
 
 
462 aa  239  9e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  41.37 
 
 
440 aa  239  9e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  41.89 
 
 
440 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 
477 aa  237  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  43.11 
 
 
444 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  40.5 
 
 
455 aa  237  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  39.37 
 
 
477 aa  236  4e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 
439 aa  236  4e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  37.86 
 
 
418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  40.97 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  40.97 
 
 
448 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
444 aa  236  7e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.46 
 
 
428 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  34.63 
 
 
401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0250  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
535 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0712  C-terminal processing peptidase-2  39.27 
 
 
425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0280534  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  38.03 
 
 
440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 
442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  39.83 
 
 
447 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  40.61 
 
 
445 aa  233  5e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  38.83 
 
 
428 aa  233  6e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  38.34 
 
 
478 aa  232  7.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  40.52 
 
 
445 aa  232  7.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 
424 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  40 
 
 
445 aa  231  1e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.48 
 
 
432 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  39.6 
 
 
449 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  35.94 
 
 
549 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  41.52 
 
 
444 aa  230  3e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  37.47 
 
 
532 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  40.17 
 
 
424 aa  230  4e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 
471 aa  229  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  35.96 
 
 
428 aa  229  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 
440 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  40.52 
 
 
476 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  40.12 
 
 
472 aa  227  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 
415 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 
538 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.24 
 
 
444 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.69 
 
 
440 aa  227  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  39.02 
 
 
437 aa  228  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  38.65 
 
 
440 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>