More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1823 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 556 aa  1131    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  54.37 
 
 		 560 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  39.81 
 
 		 528 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  42.35 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  40.91 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  38.5 
 
 		 535 aa  346  8e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  37.96 
 
 		 535 aa  340  5e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  38.09 
 
 		 575 aa  339  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  40.41 
 
 		 525 aa  336  7e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  40.77 
 
 		 535 aa  335  2e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  44.34 
 
 		 547 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  38.32 
 
 		 556 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  38.75 
 
 		 551 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  37.98 
 
 		 549 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  36.36 
 
 		 551 aa  323  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  38.52 
 
 		 555 aa  323  6e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 552 aa  322  9.999999999999999e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  35.23 
 
 		 544 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  39.07 
 
 		 526 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  34.62 
 
 		 538 aa  290  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  42.61 
 
 		 439 aa  266  8e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  34.83 
 
 		 544 aa  261  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.99 
 
 		 446 aa  261  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  44.59 
 
 		 441 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  40.45 
 
 		 432 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  39.38 
 
 		 444 aa  249  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.35 
 
 		 476 aa  248  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  42.36 
 
 		 438 aa  248  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  42.01 
 
 		 439 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  43.2 
 
 		 426 aa  247  4.9999999999999997e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  42.81 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  41.16 
 
 		 468 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  34.27 
 
 		 550 aa  244  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  41.94 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  45.65 
 
 		 415 aa  242  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.66 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 		 481 aa  240  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  32.82 
 
 		 550 aa  240  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  40.43 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  40.43 
 
 		 445 aa  239  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.78 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.34 
 
 		 445 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  40.35 
 
 		 438 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  40.36 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  39.71 
 
 		 439 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  38.59 
 
 		 444 aa  237  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  39.43 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.98 
 
 		 443 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  39.43 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 438 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  39.42 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 		 438 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  40.23 
 
 		 433 aa  236  7e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  40.62 
 
 		 439 aa  236  8e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 		 437 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  37.53 
 
 		 468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.71 
 
 		 444 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.14 
 
 		 423 aa  232  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  39.77 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  33.65 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 		 436 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 410 aa  231  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  41.28 
 
 		 440 aa  231  3e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  33.19 
 
 		 566 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  40 
 
 		 480 aa  230  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  40.65 
 
 		 455 aa  230  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 550 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  42.5 
 
 		 484 aa  230  6e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  39.5 
 
 		 440 aa  230  7e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  37.81 
 
 		 540 aa  229  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 538 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  37 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  37.83 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  37.67 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 		 439 aa  227  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.5 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  39.88 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  40.4 
 
 		 457 aa  227  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  39.94 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  37.92 
 
 		 483 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.04 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  41.88 
 
 		 484 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  32.67 
 
 		 557 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  34.31 
 
 		 565 aa  223  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  41.69 
 
 		 476 aa  223  7e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 		 418 aa  223  8e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.47 
 
 		 423 aa  223  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  40.54 
 
 		 481 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  39.34 
 
 		 479 aa  223  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  40.61 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  36.56 
 
 		 549 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  39.04 
 
 		 479 aa  220  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2829  carboxyl-terminal protease  39.64 
 
 		 478 aa  220  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  37.99 
 
 		 452 aa  220  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>