More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1529 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  61.75 
 
 
549 aa  704    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  59.74 
 
 
551 aa  690    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  67.4 
 
 
555 aa  769    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  100 
 
 
551 aa  1112    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  64.9 
 
 
556 aa  737    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  48.71 
 
 
535 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  49.91 
 
 
547 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
556 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  37.95 
 
 
575 aa  320  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  38.88 
 
 
560 aa  316  5e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  46.59 
 
 
567 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  46.86 
 
 
528 aa  311  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  43.04 
 
 
525 aa  308  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  38.78 
 
 
535 aa  297  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  41.22 
 
 
526 aa  283  5.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 
507 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 
535 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  34.58 
 
 
552 aa  256  7e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  40.51 
 
 
450 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
444 aa  244  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  30.35 
 
 
544 aa  239  1e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.1 
 
 
538 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  42.59 
 
 
433 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  38.68 
 
 
444 aa  238  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  40.74 
 
 
438 aa  237  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  39.77 
 
 
443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  39.55 
 
 
439 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 
428 aa  232  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  38.46 
 
 
444 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 
429 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  41.96 
 
 
441 aa  230  5e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  41.96 
 
 
426 aa  230  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.57 
 
 
455 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  40.38 
 
 
482 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  42.14 
 
 
484 aa  227  3e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  40.38 
 
 
482 aa  228  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 
423 aa  227  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  37.03 
 
 
410 aa  227  4e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 
455 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  41.19 
 
 
422 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  41.38 
 
 
439 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  42.32 
 
 
498 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  39.62 
 
 
443 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.9 
 
 
444 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.61 
 
 
452 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  38.51 
 
 
476 aa  223  7e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.83 
 
 
445 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  41.51 
 
 
445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  40.19 
 
 
428 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  41.14 
 
 
507 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 
434 aa  221  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
446 aa  221  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 
428 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  38.24 
 
 
457 aa  220  7e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  37.71 
 
 
441 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.52 
 
 
440 aa  218  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
443 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  38.07 
 
 
432 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 
415 aa  217  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  42.14 
 
 
438 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  42.14 
 
 
438 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.88 
 
 
439 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  42.14 
 
 
438 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40.44 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  41.19 
 
 
437 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 
445 aa  213  7.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
439 aa  213  7.999999999999999e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2252  C-terminal processing peptidase  41.19 
 
 
484 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 
468 aa  212  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  36.56 
 
 
481 aa  212  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  41.01 
 
 
444 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
478 aa  211  3e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  32.68 
 
 
478 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  40.06 
 
 
461 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 
476 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.24 
 
 
379 aa  210  7e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  38.79 
 
 
479 aa  209  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
478 aa  209  8e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.65 
 
 
445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.65 
 
 
445 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
478 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
478 aa  209  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 
469 aa  208  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 
478 aa  209  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.34 
 
 
462 aa  208  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.58 
 
 
478 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  33.97 
 
 
469 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1217  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 
444 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0468688 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 
469 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  32.44 
 
 
478 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 
446 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2101  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 
482 aa  208  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  40.26 
 
 
440 aa  207  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  38.01 
 
 
456 aa  207  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
436 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.31 
 
 
436 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  37.88 
 
 
479 aa  207  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  37.35 
 
 
480 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  40.13 
 
 
442 aa  207  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>