More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0529 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
525 aa  1050    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  54.49 
 
 
535 aa  566  1e-160  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  47.04 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  41.03 
 
 
528 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  42.15 
 
 
575 aa  368  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  37.76 
 
 
535 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  40.48 
 
 
567 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  40.82 
 
 
526 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  39.19 
 
 
507 aa  332  1e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  41.22 
 
 
556 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  37.36 
 
 
560 aa  320  6e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  36.33 
 
 
544 aa  314  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1010  carboxyl-terminal protease  35.39 
 
 
547 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  43.04 
 
 
551 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  42.78 
 
 
555 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1497  carboxyl-terminal protease  34.67 
 
 
556 aa  295  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  38.53 
 
 
549 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  36.6 
 
 
544 aa  292  1e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  42.94 
 
 
551 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1287  carboxyl-terminal protease  39.47 
 
 
535 aa  288  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  35.16 
 
 
450 aa  219  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  33.74 
 
 
538 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.97 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  35.37 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.08 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  35.05 
 
 
444 aa  212  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  37.7 
 
 
439 aa  212  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  37.54 
 
 
444 aa  211  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  37.99 
 
 
426 aa  211  3e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  36.2 
 
 
468 aa  211  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 
438 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 
443 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.26 
 
 
444 aa  209  9e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  37.25 
 
 
423 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  34.63 
 
 
429 aa  208  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 
455 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  32.68 
 
 
563 aa  207  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  37.5 
 
 
443 aa  207  4e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  35.25 
 
 
439 aa  207  5e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.05 
 
 
448 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.93 
 
 
446 aa  206  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.76 
 
 
550 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 
440 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.05 
 
 
448 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 
446 aa  206  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  35.59 
 
 
457 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 
440 aa  205  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  36.69 
 
 
444 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  33.42 
 
 
440 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.41 
 
 
569 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  35.71 
 
 
545 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  34.73 
 
 
415 aa  203  5e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.54 
 
 
449 aa  203  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.54 
 
 
443 aa  203  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
424 aa  202  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  33.16 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 
440 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  38.04 
 
 
398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.96 
 
 
440 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
424 aa  201  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  35.59 
 
 
439 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  34.76 
 
 
550 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  37.22 
 
 
439 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  31.79 
 
 
582 aa  199  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  39.22 
 
 
441 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  37.61 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  37.61 
 
 
445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  34.37 
 
 
440 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.03 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  37.38 
 
 
445 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  37.38 
 
 
445 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  38.29 
 
 
397 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  35.18 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
445 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 
438 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  36.07 
 
 
442 aa  196  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  35.16 
 
 
453 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  35.65 
 
 
456 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  31.75 
 
 
540 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  32.36 
 
 
477 aa  195  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 
458 aa  196  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
438 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
438 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.19 
 
 
452 aa  195  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.38 
 
 
438 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  33.61 
 
 
441 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.73 
 
 
410 aa  194  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  33.44 
 
 
532 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 
507 aa  194  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  34.57 
 
 
455 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  32.39 
 
 
557 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.22 
 
 
444 aa  193  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.54 
 
 
423 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  31.93 
 
 
553 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  35.6 
 
 
440 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  34.25 
 
 
555 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>