More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1991 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  100 
 
 
582 aa  1184    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  44.53 
 
 
585 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  42.41 
 
 
564 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  41.96 
 
 
565 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  40.6 
 
 
563 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  40 
 
 
572 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  38.92 
 
 
556 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  35.7 
 
 
550 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  35.74 
 
 
553 aa  301  2e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
569 aa  293  7e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  32.79 
 
 
557 aa  288  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  35.21 
 
 
540 aa  280  4e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  31.23 
 
 
550 aa  276  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  32.46 
 
 
545 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  32.99 
 
 
555 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  32.75 
 
 
566 aa  266  8e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  33.03 
 
 
552 aa  225  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  34.39 
 
 
842 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
440 aa  224  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  31.46 
 
 
556 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  37.27 
 
 
433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  39.56 
 
 
456 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  35.58 
 
 
515 aa  213  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  32.18 
 
 
538 aa  213  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  39.25 
 
 
458 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 
438 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 
444 aa  212  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  39.44 
 
 
438 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
511 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  39.44 
 
 
439 aa  211  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  36.44 
 
 
513 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 
441 aa  211  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.43 
 
 
429 aa  210  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  34.48 
 
 
452 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  30.5 
 
 
455 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 
436 aa  209  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.82 
 
 
445 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  35.73 
 
 
477 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 
437 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.75 
 
 
436 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.82 
 
 
445 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  35.59 
 
 
515 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.88 
 
 
443 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 
515 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 
515 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 
515 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  34.49 
 
 
446 aa  207  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  36.6 
 
 
443 aa  208  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  37.79 
 
 
428 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 
522 aa  207  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  35.48 
 
 
526 aa  207  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  35.94 
 
 
426 aa  206  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  38.75 
 
 
439 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  37.82 
 
 
462 aa  206  8e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  35.36 
 
 
443 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
444 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  36.66 
 
 
524 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 
524 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  36.66 
 
 
530 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  37.93 
 
 
455 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  36.66 
 
 
530 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  36.66 
 
 
524 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  36.66 
 
 
521 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.8 
 
 
444 aa  205  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  36.66 
 
 
524 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  36.66 
 
 
524 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 
530 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  35.11 
 
 
444 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 
438 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.59 
 
 
439 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  32.97 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 
423 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 
440 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  36.45 
 
 
437 aa  200  7e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  35.88 
 
 
442 aa  199  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  31.79 
 
 
525 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0227  carboxyl-terminal protease  32.92 
 
 
550 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000791174 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.83 
 
 
415 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  34.39 
 
 
477 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 
438 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 
424 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0208  carboxyl-terminal protease  33.68 
 
 
538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.582164  normal  0.210036 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  34.77 
 
 
448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.77 
 
 
448 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  34.95 
 
 
424 aa  197  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0352  putative carboxy-terminal processing protease transmembrane protein  32.27 
 
 
549 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.77017  normal  0.100187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  36.36 
 
 
463 aa  196  9e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2160  carboxyl-terminal protease  35.76 
 
 
484 aa  196  9e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0420998  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  35.57 
 
 
441 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  30.32 
 
 
535 aa  195  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  31.87 
 
 
532 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  34.92 
 
 
439 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  33.78 
 
 
478 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  35.07 
 
 
468 aa  195  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0304  carboxyl-terminal protease  35.59 
 
 
498 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000604667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.57 
 
 
463 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  34.55 
 
 
453 aa  194  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>