More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03110 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  56.48 
 
 		 545 aa  637    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  100 
 
 		 540 aa  1090    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  43.04 
 
 		 550 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  41.47 
 
 		 550 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  41.59 
 
 		 557 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  39.11 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  39.67 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  36.15 
 
 		 569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  33.9 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  34.39 
 
 		 572 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  35.21 
 
 		 582 aa  280  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.75 
 
 		 563 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  32.22 
 
 		 564 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  32.15 
 
 		 556 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  32.59 
 
 		 565 aa  265  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  33.27 
 
 		 585 aa  250  6e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0689  C-terminal processing peptidase-3  34.39 
 
 		 528 aa  236  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 556 aa  229  1e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  29.62 
 
 		 507 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 567 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04000  putative carboxy-terminal protease  33.11 
 
 		 535 aa  220  6e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  39.43 
 
 		 440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  39.17 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.14 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1023  hypothetical protein  29.61 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  37.62 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  37.61 
 
 		 439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 415 aa  214  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 		 444 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 418 aa  214  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  39.18 
 
 		 441 aa  213  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  32.06 
 
 		 842 aa  210  5e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  37.62 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  38.04 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  29.43 
 
 		 535 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  39.57 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  39.26 
 
 		 444 aa  208  2e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  37.93 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 445 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  38.17 
 
 		 398 aa  207  4e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.33 
 
 		 444 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  36.01 
 
 		 433 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  37.23 
 
 		 444 aa  207  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  37.81 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 448 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 441 aa  206  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  35.47 
 
 		 461 aa  206  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 439 aa  203  7e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  37.81 
 
 		 462 aa  203  7e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  38.49 
 
 		 443 aa  203  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 		 471 aa  202  9e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  36.88 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0848  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  37.07 
 
 		 419 aa  202  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0053756  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  35.92 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  36.49 
 
 		 444 aa  201  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  36.92 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  36.21 
 
 		 443 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  36.91 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3779  carboxyl-terminal protease  32.74 
 
 		 526 aa  199  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 455 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 437 aa  200  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  37.36 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  34.75 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  35.01 
 
 		 444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  34.52 
 
 		 555 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 449 aa  197  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  36.45 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  36.96 
 
 		 423 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  33.52 
 
 		 410 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0490  carboxyl-terminal protease  40.56 
 
 		 400 aa  196  6e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 		 443 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  34.12 
 
 		 544 aa  196  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  38.51 
 
 		 445 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  38.51 
 
 		 445 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 434 aa  196  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0529  carboxyl-terminal protease  31.75 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.25 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  36.71 
 
 		 432 aa  195  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  37.19 
 
 		 437 aa  195  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 442 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  35.9 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 428 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 438 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1529  C-terminal processing peptidase-3  34.77 
 
 		 551 aa  193  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0961  peptidase S41A, C-terminal protease  35 
 
 		 549 aa  193  9e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.916268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  36.55 
 
 		 438 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.53 
 
 		 476 aa  191  2e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.84 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  36.55 
 
 		 438 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  36.36 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>