More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3850 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  72.64 
 
 		 557 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 550 aa  1122    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  52.01 
 
 		 550 aa  588  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  43.78 
 
 		 555 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  43.04 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  41.82 
 
 		 545 aa  442  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  42.42 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  42.69 
 
 		 569 aa  405  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  37.34 
 
 		 553 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  35.24 
 
 		 572 aa  322  8e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  35.7 
 
 		 582 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  35.66 
 
 		 565 aa  310  5e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  36.09 
 
 		 585 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  33.64 
 
 		 564 aa  307  3e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  33.92 
 
 		 556 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  33.58 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  35.25 
 
 		 556 aa  243  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  38.35 
 
 		 418 aa  232  1e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  38.36 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  31.99 
 
 		 538 aa  227  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  42.09 
 
 		 398 aa  223  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  37.8 
 
 		 439 aa  223  9.999999999999999e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  36.99 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  36.74 
 
 		 449 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49652  predicted protein  32.01 
 
 		 842 aa  217  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.390924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  38.37 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.82 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  40.2 
 
 		 444 aa  214  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1545  carboxyl-terminal protease  34.29 
 
 		 552 aa  213  4.9999999999999996e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.161326  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  39.54 
 
 		 444 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 462 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  37.81 
 
 		 444 aa  213  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  35.78 
 
 		 439 aa  213  9e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  35.77 
 
 		 434 aa  213  9e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  33.17 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  33.25 
 
 		 448 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  33.25 
 
 		 560 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.98 
 
 		 440 aa  212  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 444 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  34.7 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  37.46 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2453  carboxyl-terminal protease  36.76 
 
 		 455 aa  211  4e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493491  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  35.46 
 
 		 483 aa  210  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  34.66 
 
 		 441 aa  210  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  33.96 
 
 		 440 aa  210  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  33.99 
 
 		 471 aa  210  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 444 aa  209  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.14 
 
 		 428 aa  209  8e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  34.6 
 
 		 449 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  37.65 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  35.67 
 
 		 441 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  35.65 
 
 		 480 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  36.65 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  37.35 
 
 		 437 aa  209  2e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  37.42 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  36.56 
 
 		 441 aa  208  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  34.81 
 
 		 426 aa  208  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  37.11 
 
 		 443 aa  207  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  36.68 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 		 468 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  35.53 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 456 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  35.44 
 
 		 438 aa  207  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  38.05 
 
 		 445 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  34.88 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0235  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 507 aa  206  7e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  35.14 
 
 		 440 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  38.05 
 
 		 445 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 		 440 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  34.86 
 
 		 379 aa  206  9e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  34.84 
 
 		 440 aa  206  9e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3921  carboxyl-terminal protease  31.43 
 
 		 567 aa  205  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  35.94 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  37.3 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  36.28 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 451 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  37.3 
 
 		 482 aa  205  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  35.94 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  35.51 
 
 		 443 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  35.89 
 
 		 446 aa  204  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  37.5 
 
 		 440 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  36.79 
 
 		 437 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  36.91 
 
 		 461 aa  205  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  36.31 
 
 		 450 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.21 
 
 		 463 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  34.81 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0303  peptidase S41A, C-terminal protease  33.87 
 
 		 532 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.955856  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  35.78 
 
 		 478 aa  204  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 458 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  34.65 
 
 		 442 aa  203  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  34.56 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  36.28 
 
 		 439 aa  203  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  37.06 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  35.19 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  36.02 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  34.59 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>